当药店因破产等原因与员工解除劳动合同时，员工的赔偿问题主要依据《劳动合同法》的相关规定来处理。以下是对这一问题的详细解答：

一、经济补偿的计算方式

根据《劳动合同法》，药店因破产与员工解除劳动合同时，需要按照员工在本单位的工作年限来给予经济补偿。具体计算方式如下：

1. 每满一年支付一个月工资：如果员工在药店工作满一年，药店应支付其一个月的工资作为经济补偿。

2. 六个月以上不满一年的按一年计算：如果员工在药店工作超过六个月但不满一年，药店也应支付其一个月的工资作为经济补偿。

3. 不满六个月的支付半个月工资：如果员工在药店工作不满六个月，药店应支付其半个月的工资作为经济补偿。

这里的“月工资”是指员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

二、赔偿的争议解决

如果药店拒绝支付经济补偿，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 协商：首先，员工可以尝试与药店进行协商，看是否能够达成赔偿协议。

2. 投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并帮助解决问题。

3. 仲裁：员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，由仲裁委员会对争议进行裁决。

4. 诉讼：如果员工对仲裁结果不服，还可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

三、实际案例

以小胡为例，他在一家药店工作了两年零三个月。后来药店因经营不善倒闭，要与小胡解除劳动合同。但药店拒绝向小胡支付经济补偿。根据《劳动合同法》的规定，小胡工作两年零三个月，药店应支付其两个月工资作为经济补偿。如果药店拒绝支付，小胡可以先与药店协商，协商不成可以向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。若对仲裁结果不服，还能在规定时间内向人民法院提起诉讼。

综上所述，当药店因破产等原因与员工解除劳动合同时，员工应依据《劳动合同法》的规定来要求经济补偿，并在必要时通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。