结论：在业务员未合规进行药品推广，且公司怀疑其给医生回扣的情况下，公司是否可以去纪委反映情况，需结合具体情况判断，但一般而言，公司有权向相关部门反映，不过需注意方式方法和证据收集。

一、公司有权向相关部门反映

1. 公司作为市场主体：公司作为药品推广的委托方，对业务员的推广行为有监督权和管理权。当发现业务员存在不合规行为，甚至涉嫌违法（如给医生回扣）时，公司有权向相关部门反映情况，以维护自身合法权益和市场秩序。

2. 纪委的职责范围：纪委主要负责党内监督和纪律检查工作，对于涉及公职人员（如医生中的党员）的违纪违法行为，纪委有权进行调查和处理。如果业务员给医生回扣的行为涉及公职人员，且该行为违反了党纪国法，那么公司向纪委反映情况是合理的。

二、需注意方式方法和证据收集

1. 方式方法：

   • 合法合规：公司在向纪委反映情况时，必须确保反映的内容真实、准确，且反映的方式合法合规。不得捏造事实、诬告陷害他人。
   • 选择适当渠道：公司可以根据具体情况，选择向纪委直接反映，或者通过其他合法渠道（如向卫生行政部门、市场监管部门等）进行反映。

2. 证据收集：

   • 关键证据：公司在反映情况时，应尽可能提供充分的证据来支持其主张。这些证据可以包括业务员的推广记录、与医生的沟通记录、资金往来记录等。
   • 证据合法性：收集的证据必须合法有效，不得通过非法手段获取证据。否则，证据可能被视为无效，甚至可能导致公司承担法律责任。

三、可能面临的法律后果

1. 如果业务员行为违法：如果业务员给医生回扣的行为确实违反了法律法规（如《反不正当竞争法》、《刑法》等），那么业务员可能面临行政处罚或刑事处罚。同时，公司作为委托方，如果未尽到监督和管理责任，也可能承担一定的法律责任。

2. 如果反映情况不实：如果公司向纪委反映的情况不实，或者捏造事实诬告陷害他人，那么公司可能面临法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事处罚。

四、建议与措施

1. 加强内部管理：公司应加强对业务员的培训和管理，确保其推广行为合规合法。同时，建立完善的监督机制，及时发现并纠正不合规行为。

2. 积极收集证据：如果公司怀疑业务员存在不合规行为，应积极收集相关证据，以便在需要时向相关部门反映情况。

3. 咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，公司可以咨询专业律师的意见和建议，以确保自身行为的合法性和有效性。

后续思考依据：公司在面对业务员不合规推广行为时，应综合考虑法律后果、证据收集以及内部管理等多方面因素。通过加强内部管理、积极收集证据并咨询专业律师，公司可以更好地维护自身合法权益和市场秩序。如果有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。