单位破产时，员工的赔偿由破产公司的破产财产进行支付。具体来说，员工的赔偿权益及支付方式可以从以下几个方面详细阐述：

一、赔偿权益的法律依据

根据《劳动合同法》和《企业破产法》的相关规定，公司破产时，员工享有法定的赔偿权益。这些权益包括但不限于经济补偿金、拖欠的工资及福利、社会保险和住房公积金的补缴等。

二、经济补偿金的计算与支付

1. 计算标准：

   • 经济补偿按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
   • 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
   • 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

2. 支付方式：

   • 经济补偿金由破产管理人负责核算，并从破产财产中优先支付。

三、工资、加班工资及津贴的支付

1. 工资支付：

   • 公司应支付破产前员工正常出勤的工资，包括基本工资、绩效工资、奖金等。

2. 加班工资：

   • 依法支付加班工资，平时加班不低于工资的150%，休息日加班且不能补休的不低于200%，法定节假日加班不低于300%。

3. 津贴、补贴：

   • 岗位津贴、交通补贴、餐补等属于工资组成部分的项目也应支付至破产清算时。

四、社会保险及住房公积金的补缴

1. 社会保险：

   • 公司需补缴欠缴的社会保险费用，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，以保障员工社保权益。

2. 住房公积金：

   • 公司同样需补缴欠缴的住房公积金，以支持员工住房需求。

五、特殊员工的额外保障

1. 孕期、产期、哺乳期女职工：

   • 除经济补偿金外，还应额外支付至哺乳期满的工资等费用，保护特殊时期女职工的权益。

2. 工伤员工：

   • 按照工伤保险相关规定支付一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等费用。

六、破产财产的清偿顺序与优先受偿权

1. 清偿顺序：

   • 根据《企业破产法》的规定，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
     1. 破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金。
     2. 破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款。
     3. 普通破产债权。

2. 优先受偿权：

   • 员工的工资、经济补偿、社会保险费用等在破产财产分配中享有优先受偿权，优于其他普通债权。

七、员工的行动建议

1. 密切关注破产清算进展：

   • 员工应密切关注公司破产清算的进展情况，及时了解自己的赔偿权益和支付进度。

2. 积极配合破产管理人：

   • 员工应积极配合破产管理人的工作，提供必要证据和材料以便准确计算赔偿数额。

3. 通过法律途径维护权益：

   • 若认为自己的权益受损，员工可以通过法律途径维护自己的合法权益，如申报债权、参与破产程序等。

总结来说，单位破产时，员工的赔偿由破产公司的破产财产进行支付，且员工的赔偿权益在破产财产分配中享有优先受偿权。员工应密切关注破产清算进展，积极配合破产管理人，并在必要时通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。