结论前置：在债务债权纠纷中，若被告已偿还部分款项，但起诉时仍按全额主张，这通常不会影响案件的最终判决结果，因为法院会根据实际证据和法律规定来确定被告应偿还的金额。不过，被告在应诉时，应积极提供已还款的证据，以维护自身权益。
一、法律背景与原则
在债务债权关系中，债权人有权要求债务人按照约定履行还款义务。当债务人未能全额履行还款义务时，债权人有权向法院提起诉讼，要求债务人偿还剩余债务。然而，如果债务人在诉讼前或诉讼过程中已经偿还了部分款项，那么这部分款项应当从总债务中扣除。
法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债务人应当按照约定的期限和方式履行还款义务。如果债务人部分履行了还款义务，那么这部分履行应当被认可，并从总债务中相应扣除。
二、被告已还款但起诉全额的情况分析
起诉时的全额主张：
- 债权人在起诉时，可能基于多种原因（如未及时更新账目、疏忽等）仍按全额主张债务。这并不意味着法院会直接按此金额判决。
- 法院在审理案件时，会要求双方提供证据，包括还款记录、转账凭证等，以查明实际债务情况。
被告的应诉策略：
- 被告在收到起诉状后，应积极应诉，并提供已还款的证据。这些证据可以包括银行转账记录、收据、聊天记录等。
- 被告可以在答辩状中明确指出已还款的金额和时间，并要求法院从总债务中扣除这部分款项。
法院的判决依据：
- 法院在判决时，会根据双方提供的证据和法律规定来确定被告应偿还的金额。
- 如果被告能提供充分的证据证明已还款，法院通常会认可这部分还款，并从总债务中扣除。
三、可能的法律后果与建议
法律后果：
- 如果被告未能提供已还款的证据，或者证据不足，法院可能会按起诉时的全额判决被告偿还债务。
- 如果被告提供了充分的证据，法院会按实际债务情况判决，这可能意味着被告只需偿还剩余债务。
建议：
- 被告在应诉时，应积极收集并提供已还款的证据，以维护自身权益。
- 如果被告对法律程序不熟悉，或者担心证据收集不全，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助被告更好地应对诉讼。
四、实际操作中的注意事项
- 及时沟通：被告在收到起诉状后，应及时与债权人沟通，了解起诉的具体原因和金额，并尝试协商解决。
- 保留证据：被告应妥善保管所有与还款相关的证据，包括转账记录、收据、聊天记录等。这些证据在诉讼中可能起到关键作用。
- 遵守法律程序：被告应按照法律程序应诉，按时提交答辩状、参加庭审等。如果被告未能按时应诉或提供证据，可能会影响案件的判决结果。
总结：在债务债权纠纷中，若被告已偿还部分款项但起诉时仍按全额主张，被告应积极应诉并提供已还款的证据。法院会根据实际证据和法律规定来确定被告应偿还的金额。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。