摩托车交通肇事逃逸后，交警通常会扣车。以下是对此问题的详细分析：
一、扣车依据
根据相关规定，因收集证据的需要，公安机关交通管理部门有权扣留事故车辆。在摩托车交通肇事逃逸的案件中，交警为了查明事故真相、收集证据，会依法扣留涉事摩托车。这是为了确保事故调查的顺利进行，以及后续责任认定的准确性。
二、扣车期限与通知
扣车期限：若需要进行检验、鉴定的，公安机关交通管理部门应当自事故现场调查结束之日起三日内委托具备资质的鉴定机构进行检验、鉴定。检验、鉴定的期限一般不得超过三十日。这意味着，在大多数情况下，扣车期限不会超过三十日，但具体期限可能因案件复杂性和鉴定需要而有所延长。
通知领车：一般情况下，自检验报告、鉴定意见确定之日起五日内，公安机关交通管理部门应当通知当事人领取扣留的事故车辆。这确保了当事人在事故处理完毕后能够及时取回自己的车辆。
三、扣车后的处理
责任认定：在扣车期间，交警部门会对事故进行调查，并根据现场勘查、调查取证等情况，对是否构成肇事逃逸作出认定。这属于行政认定范畴，是后续处理的基础。
后续处理：若被认定为肇事逃逸，且不构成犯罪，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。若肇事逃逸构成犯罪，比如致人重伤、死亡或使公私财产遭受重大损失等，将由公安机关立案侦查，之后会进入刑事诉讼程序，由检察院提起公诉，最终由法院进行判决。
四、特殊情况与注意事项
特殊情况：在某些特殊情况下，如车辆涉及重大刑事案件或存在其他需要进一步调查的情况，扣车期限可能会延长。但这种情况相对较少，且需要严格的法律程序和审批。
注意事项：作为车主或驾驶员，在发生交通事故后应立即停车并保护现场，积极配合交警部门的调查和处理工作。如果因特殊原因需要离开现场，应留下联系方式并尽快返回处理。避免因逃逸行为而承担更严重的法律后果。
总结与建议：摩托车交通肇事逃逸后，交警通常会扣车以收集证据和查明事故真相。作为车主或驾驶员，应积极配合交警部门的调查和处理工作，避免因逃逸行为而承担更严重的法律后果。如果您在交通事故处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。