当三轮车和摩托车发生事故时，赔偿问题的处理需要遵循一系列法律程序和原则。以下是一份清晰、详细且有深度的解答：

一、事故责任认定

1. 法律依据： 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十三条，公安机关交通管理部门在接到交通事故报警后，会及时赶赴现场进行勘验、检查、调查，并根据相关检验、鉴定结论制作交通事故认定书。这份认定书是处理交通事故的重要证据。

2. 责任划分： 事故责任可能包括三轮车全责、摩托车全责、双方主次责任或同等责任等。具体责任划分将依据双方在事故中的过错行为来确定，如是否违反交通规则、是否保持安全距离等。

二、赔偿原则与项目

1. 赔偿原则：

   • 若三轮车为机动车，且有过错，则应承担相应的赔偿责任；若双方都有过错，则按各自过错比例分担责任。
   • 若三轮车为非机动车，且摩托车为机动车，非机动车驾驶人有过错的，适当减轻机动车一方的责任；机动车一方无过错的，承担不超过百分之十的责任。

2. 赔偿项目：

   • 人身损害赔偿：包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、营养费等。若事故导致残疾或死亡，还需赔偿残疾赔偿金、残疾辅助器具费、丧葬费、被扶养人生活费、死亡赔偿金等。
   • 财产损失赔偿：包括车辆维修费用、车载物品损失以及经营性车辆的停运损失等。

三、保险赔偿

1. 交强险赔偿： 只要投保车辆一方负有事故责任，不论责任大小，保险公司均需在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。这包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。

2. 商业险赔偿： 若三轮车还投保了商业第三者责任险，交强险赔偿不足的部分，将由商业险在保险合同约定的范围内按事故责任比例进行赔偿。

四、赔偿方式与流程

1. 保险赔付： 在事故责任认定后，摩托车方或三轮车方（根据责任划分）应首先向各自的保险公司报案，并提供相关证据文件，如事故责任认定书、维修费用清单等。保险公司将根据保险合同和事故责任进行赔付。

2. 个人赔偿： 若保险金额不足以覆盖全部损失，或三轮车未投保相关保险，剩余部分将由责任方按比例承担。此时，双方应协商确定赔偿金额和支付方式。

3. 争议解决：

   • 调解：当事人可请求公安机关交通管理部门进行调解，以达成赔偿协议。
   • 诉讼：若调解不成或调解书生效后不履行，当事人可直接向人民法院提起民事诉讼，通过法律途径解决纠纷。

五、建议与注意事项

1. 及时报警： 事故发生后，应立即报警并等待交警到来进行事故认定。这是处理交通事故的第一步，也是后续赔偿的重要依据。

2. 保留证据： 在事故处理过程中，应保留好相关证据文件，如事故现场照片、维修费用清单、医疗费用发票等。这些证据将在后续的赔偿协商或诉讼中发挥重要作用。

3. 寻求专业帮助： 若遇争议或无法自行处理赔偿事宜，建议寻求专业法律帮助。律师或法律援助机构可以提供法律咨询和代理服务，帮助当事人维护自身权益。

综上所述，三轮车和摩托车发生事故时的赔偿问题涉及多个法律环节和原则。在实际操作中，应严格按照法律法规进行处理，并保留好相关证据文件。若遇争议或无法自行处理，可寻求专业法律帮助以维护自身权益。