在食品行政处罚案件中，违法所得的计算方法主要依据《食品安全法》及相关规定，采用“全额说”，即违法所得按全部销售收入计算，不扣除成本。以下是对这一计算方法的详细解释及特殊情形处理：

一、基本计算方法

在食品行政处罚案件中，违法所得的计算通常遵循“全额说”原则。这意味着，无论销售者是否盈利，只要其销售了不符合食品安全标准的食品，其全部销售收入都将被视为违法所得。例如，若某商家销售了价值1000元的过期食品，那么这1000元就将被视为违法所得，不扣除任何成本。

法律依据：

• 《食品安全法》第一百二十二条、第一百二十三条均规定了对于违反食品安全标准的行为，应没收违法所得，并处以罚款。这里的违法所得，即指全部销售收入。

二、特殊情形处理

尽管“全额说”是食品行政处罚案件中违法所得计算的主要原则，但也存在一些特殊情形需要特别注意：

1. 经营者履行进货查验义务且无主观过错：

   • 若经营者能够证明其已履行了进货查验义务，且对销售的食品不符合食品安全标准并无主观过错，那么根据《食品安全法》第一百三十六条的规定，可以免予处罚，且不没收违法所得。

2. 违法所得无法计算：

   • 在某些情况下，如无交易记录或交易记录不完整，违法所得可能难以计算。此时，部分领域（如价格违法）可能按“无违法所得”处罚，即罚款额度可能更高。但需注意，总局征求意见稿拟调整为“不予没收，在罚款额度中综合考虑”。

3. 共同违法与多次违法：

   • 对于共同违法的情况，违法所得应按各自参与程度、分赃比例等证据判定。无法区分时，需结合个案证据综合裁量。
   • 对于多次违法的情况，违法所得应累计计算。但需注意追溯时效，详情可查看《行政处罚法》第三十六条。

三、执法原则与注意事项

在计算食品行政处罚案件中的违法所得时，执法人员需严格遵循“特别法优先、程序合法、证据充分”的原则。同时，应密切关注行业特性和最新法律动态，确保处罚合法合理、过罚相当。特别是在食品领域，由于采用“全额说”计算违法所得，执法人员需更加谨慎地收集证据，确保违法所得的准确计算。

建议：

• 对于食品销售者而言，应严格遵守食品安全标准，确保所售食品符合法律法规要求。
• 若不幸涉及食品行政处罚案件，应积极配合执法人员的调查工作，提供必要的证据和资料。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。