法院确定优先权后签订的抵房协议，在符合法律规定和合同约定的情况下，通常是有效的。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、协议的有效性基础
意思表示真实：抵房协议作为双方民事法律行为，其有效性首先要求双方的意思表示真实、一致。如果双方在签订协议时均出于自愿，且协议内容反映了双方的真实意愿，那么该协议在形式上即具备了有效性。
不违反法律、行政法规的强制性规定：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。因此，抵房协议的内容必须合法，不得存在违反法律、行政法规的情形，否则可能导致协议无效。
法院确定优先权的影响：法院确定优先权通常是在涉及债务清偿、财产分配等法律程序中，对特定财产或权益的优先受偿权进行确认。这一确认本身并不直接决定抵房协议的效力，但可能对协议的履行产生影响。例如，如果抵房协议涉及的房产已被法院确定为某债权人的优先受偿财产，那么该协议在履行时可能受到限制或需要经过特定程序。
二、可能影响协议效力的因素
协议签订时的法律状态：如果抵房协议签订时，涉及的房产已被法院查封、扣押或冻结，或者存在其他法律上的障碍（如权属争议、抵押权等），那么该协议的效力可能受到影响。在这种情况下，即使双方意思表示真实，也可能因违反法律强制性规定而无效。
协议内容的合法性：抵房协议的内容必须合法，不得存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形。如果协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者损害国家、集体或第三人的利益，那么该协议可能被认定为无效。
法院优先权确认的具体内容：法院确定优先权的具体内容（如优先受偿的范围、期限等）可能对抵房协议的履行产生影响。如果抵房协议的内容与法院优先权确认的内容存在冲突或不一致，那么该协议在履行时可能面临法律障碍。
三、法律建议
审查协议内容：在签订抵房协议前，双方应仔细审查协议内容，确保协议内容合法、合规，且不违反法院优先权确认的内容。
咨询专业律师：由于涉及法律程序和优先权问题，建议双方在签订抵房协议前咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
关注法律变化：在协议履行过程中，双方应关注相关法律的变化和法院优先权确认的进展情况，以便及时调整协议履行方案。
有问题可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供进一步的法律建议。