合约中甲方违约金的计算方式，首先需依据合同的具体约定；若无约定，则根据相关法律规定来确定，旨在确保违约金的计算既合法又合理，从而保障双方权益。以下从有约定和无约定两个角度，为您详细阐述：

一、有约定时的计算方式

当甲乙双方的合作协议书中明确约定了甲方违约金的计算方法时，应严格按照合同约定执行。常见的约定方式包括：

1. 固定金额：合同直接规定甲方若违约需支付给乙方一定数额的金钱。例如，合作协议中可能约定，甲方若未按约定时间提供服务，需支付违约金1万元。此情况下，甲方违约即需支付该固定金额。

2. 比例计算：合同约定以某个基数（如合同总金额、逾期金额等）的一定比例作为违约金。如合作协议中可能约定，甲方逾期完成项目，每逾期一日，需按照合同总金额的0.05%支付违约金。假设合同总金额为100万元，逾期10天，则违约金为5000元（1000000×0.05%×10）。

二、无约定时的计算方式

若合作协议书未约定甲方违约金的计算方法，则需根据相关法律规定来确定。此时，违约金的计算通常遵循以下原则：

1. 依据法定损失赔偿规则：

   • 根据《民法典》的相关规定，甲方不履行合同义务或履行不符合约定，造成乙方损失的，应赔偿乙方因违约所造成的实际损失，包括合同履行后可获得的利益，但赔偿额不得超过甲方订立合同时预见到或应当预见到的因违约可能造成的损失。
   • 例如，在合作项目中，甲方违约导致项目延期，乙方因此产生了额外的成本（如人工费、设备租赁费等）和可得利润损失，这些均应由甲方赔偿。

2. 不同类型合同的特殊规定：

   • 对于特定类型的合同，如借款合同、买卖合同等，法律可能对违约金的计算有特别规定。例如，在借款合同中，若双方对逾期利率有约定，则从其约定，但不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率的四倍；未约定或约定不明的，出借人可主张借款人按当时一年期贷款市场报价利率标准计算逾期利息。

三、实际操作建议

1. 明确约定：为避免未来可能出现的纠纷，建议在签订合作协议书时，双方应明确约定违约金的计算方法及数额。这不仅可以提高合同的严谨性和可执行性，还能在违约发生时迅速确定赔偿金额。

2. 合法合规：在约定违约金时，应注意遵守相关法律法规，确保合同条款的合法性。例如，违约金的数额不得过高或过低，以免被法院认定为“过分高于造成的损失”或“低于造成的损失”而进行调整。

3. 争议解决：若双方对违约金的计算存在争议，应首先尝试通过协商解决。协商不成的，可通过仲裁或诉讼等法律途径寻求裁决。在此过程中，建议双方保留好相关证据，以便在仲裁或诉讼中证明自己的主张。

作为专业律师，我建议您在签订合作协议书时务必谨慎对待违约金的约定条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。