在商业秘密侵权案件中，确定被告需根据案件具体情况、所掌握的证据及维权主张来综合判断。具体来说：
一. 被告类型的确定
跳槽职工与其所在单位列为共同被告：
- 员工跳槽后，将原单位的商业秘密带到新单位并加以披露和使用，构成商业秘密侵权。在此情况下，权利人可以将跳槽员工与其所在新单位列为共同被告，以便更好地获得赔偿并彻底解决问题。
- 例如，某员工离职后加入新公司，并将原公司的商业秘密泄露给新公司，原公司可将该员工及新公司共同列为被告。
仅将跳槽职工列为被告：
- 如果权利人没有充足证据证明新单位的侵权行为，可以选择仅将跳槽职工列为被告进行违约或侵权之诉。这种方式可以减轻举证责任，增强胜诉的把握。
- 例如，权利人无法证明新公司使用了其商业秘密，但可证明跳槽员工违反了竞业禁止约定，此时可仅起诉跳槽员工。
不涉及跳槽职工时，将侵权单位列为被告：
- 并非所有商业秘密侵权案件都由跳槽员工引发。当他人以不正当手段获取、披露、使用或允许他人使用商业秘密时，该侵权人或单位应成为被告。
- 例如，某公司通过非法手段获取了另一公司的商业秘密并加以使用，此时被侵权公司可将该侵权公司列为被告。
二. 法律依据
- 根据《民事诉讼法》第一百零八条的相关规定，“明确的被告”是原告提起民事诉讼的条件之一。
- 根据《反不正当竞争法》第十条的规定，经营者不得采用盗窃、利诱、胁迫或其他不正当手段获取权利人的商业秘密，也不得披露、使用或允许他人使用以不正当手段获取的商业秘密。第三人明知或应知前款所列违法行为，仍获取、使用或披露他人的商业秘密，也视为侵犯商业秘密。
三. 总结与建议
在确定商业秘密侵权案件的被告时，权利人应充分考虑案件的具体情况和所掌握的证据，合理选择被告类型。同时，也要注意收集并保存相关证据，以便在诉讼中证明自己的主张。我建议权利人在起诉前进行充分的调查和证据收集工作，以确保诉讼的成功率。如有进一步需要，您可以继续咨询我。