当企业资不抵债并进入破产程序时，其债务的处理需严格遵循《企业破产法》及相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、破产程序的启动与清算组织的成立
破产程序的启动：当企业无法清偿到期债务，且资产不足以清偿全部债务时，债权人或债务人可以向人民法院提出破产申请。人民法院在审查后，若认为符合破产条件，将裁定宣告企业进入破产还债程序。
清算组织的成立：人民法院会组织有关机关和人员成立清算组织，负责破产财产的保管、清理、估价、处理和分配。清算组织对人民法院负责，并报告工作。
二、破产财产的清偿顺序
破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，将按照以下顺序进行清偿：
职工债权：包括职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，和法律、行政法规规定应支付给职工的补偿金。
社保费用和法定补偿金：企业欠缴的社会保险费用和法定补偿金也需在此阶段清偿。
税款：企业所欠的税款将在清偿职工债权和社保费用后进行清偿。
普通破产债权：在清偿完上述债务后，剩余的破产财产将用于清偿普通破产债权。若破产财产不足以清偿同一顺序的全部债务，将按比例分配。
三、特殊债权的处理
有担保的债权：对于有担保的债权，债权人可以就担保物优先受偿。这意味着，如果企业有抵押或质押的财产，这些财产将首先用于偿还对应的债权。
股东责任：若发现公司股东存在出资不实、抽逃出资等情形，管理人可要求股东补缴出资，用于偿债。此外，若股东未依法履行出资义务，还可能在未出资本息范围内对公司债务承担补充赔偿责任。
四、债权申报与债权人会议
债权申报：债权人应在规定的时间内向人民法院申报债权，说明债权的数额和有无财产担保，并提交有关证据。逾期未申报债权的，视为放弃债权。
债权人会议：债权人可以组成债权人会议，讨论通过破产财产的处理和分配方案或者和解协议。企业法人与债权人会议达成和解协议的，经人民法院认可后，由人民法院发布公告，中止破产还债程序。
五、破产程序的终结与后续
破产程序的终结：当破产财产分配完毕，或破产程序因其他原因需要终结时，人民法院将裁定终结破产程序。
后续事项：破产程序终结后，未清偿的债务通常不再清偿。但债权人仍可通过其他法律途径（如追究股东责任、追回隐匿财产等）来维护自身权益。
六、建议与注意事项
综上所述，当企业资不抵债并进入破产程序时，其债务的处理需遵循严格的法律程序和清偿顺序。债权人应密切关注破产程序的进展，及时申报债权，并积极参与债权人会议，以维护自身权益。