结论：员工被采取刑事强制措施后不予起诉的，其工资待遇在特定期间内会受到影响，但经审查核实后，若符合一定条件，可以恢复工资待遇并补发减发的工资。
分析说明：
被采取刑事强制措施期间的工资待遇：
- 根据相关规定，员工在被取保候审、监视居住、刑事拘留、逮捕期间，其工资待遇会受到影响。具体来说，会停发工资待遇，并按本人原基本工资的75%计发生活费，且此期间不计算工作年限。这是为了保障员工在被采取刑事强制措施期间的基本生活需求，同时避免其因被限制自由而获得不正当的工资收益。
不予起诉后的工资待遇恢复：
- 若经审查核实，公安机关撤销案件或人民检察院不起诉或人民法院宣告无罪、免予刑事处罚，且员工未被收容教育、强制隔离戒毒、劳动教养、行政拘留，也未受处分的，其工资待遇可以恢复。这意味着，如果员工最终未被定罪或处罚，且没有其他不良记录，其工资待遇应恢复到被采取刑事强制措施前的水平。
- 同时，减发的工资也会予以补发。这是为了保障员工的合法权益，避免其因被错误采取刑事强制措施而遭受经济损失。
- 此外，被采取强制措施期间也会计算工作年限。这是为了保障员工的工作年限连续计算，不影响其未来的职业发展。
法律建议：
- 对于员工而言，如果遭遇被采取刑事强制措施的情况，应积极配合调查，尽快澄清事实，以避免不必要的法律纠纷和经济损失。
- 同时，员工也有权了解自己的工资待遇情况，并在符合条件时要求恢复工资待遇和补发减发的工资。
- 对于用人单位而言，应严格按照相关规定处理员工的工资待遇问题，避免因处理不当而引发劳动争议。
行动指南：
- 如果员工被采取刑事强制措施后不予起诉，且符合恢复工资待遇的条件，应及时向用人单位提出申请，并提供相关证明材料。
- 用人单位在收到员工的申请后，应及时进行审查核实，并在符合条件的情况下尽快恢复员工的工资待遇和补发减发的工资。
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