代课老师请假是否扣工资，需视具体情况和学校规定而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、学校有明确请假扣款规定的情况
因私请假：
- 若代课老师因私请假，且自行安排好了各项工作（如班主任和助理班主任工作、上课、值班、护导等），但产生了代班主任和助理班主任费，这部分费用可能会按照日平均绩效工资额扣除。同时，如果产生了代课（代值班等）费，每节次也可能有固定扣款（如每节次10元），这部分费用由请假教师本人自行承担。
- 若代课老师因私请假且自己不能安排各项工作，需要学校负责安排，那么产生的代班主任和助理班主任费同样会按照日平均绩效工资额扣除，代课（代值班）费每节次扣款可能更高（如每节次20元），这些费用会从请假教师的绩效工资中扣除，并补助给代课（代值日）教师。
因病请假：
- 代课老师因病住院（以医院的入院、出院手续为准），每天可能会扣一定金额（如每天扣10元），同时产生的代班主任和助理班主任费按照日平均绩效工资额扣除，代课（代值班等）费每节次也有扣款（如每节次10元），这些费用从请假教师绩效工资中扣除，并补助给代课（代值日）教师。
- 若学期内病假累计达到一定天数（如60个工作日），本学期奖励性绩效工资和核增工资奖可能均不予发放。
事假：
- 代课老师每学期累计请事假在一定天数以内（如五天以内），每天可能会扣一定金额（如每天扣30元）。
- 若请假超过一定天数（如五天），每超一天扣款可能更高（如每超一天扣80元）。
- 若学期内事假累计达到一定天数（如20个工作日），本学期奖励性绩效工资和核增工资奖也可能均不予发放。
二、学校无明确规定或规定不合法的情况
若学校无明确请假扣款规定：
- 代课老师请假是否扣工资，需根据学校与老师之间的劳动合同或相关协议来确定。如果合同或协议中没有明确规定，那么学校可能无权随意扣款。
若学校规定不合法：
- 根据《劳动法》和相关规定，职工带薪年休假是由法律明确规定的，是职工的法定权利，也是用人单位的法定义务。除职工因本人原因且书面提出不休年休假外，用人单位应当根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假或者按照该职工日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬。
- 如果学校的请假扣款规定违反了法律法规，那么这些规定可能是无效的，代课老师有权拒绝执行，并可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁。
三、建议与注意事项
查看学校规定：
- 代课老师应首先查看学校的请假制度和工资发放规定，了解自己在请假情况下的工资待遇。
保留证据：
- 如果代课老师认为学校的扣款规定不合法或不合理，应保留相关证据（如请假条、工资条、学校规定等），以便在需要时维护自己的合法权益。
协商与沟通：
- 如果代课老师对学校的扣款规定有异议，可以与学校进行协商和沟通，寻求合理的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，代课老师可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，必要时也可以寻求法律援助或咨询专业律师。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律意见和解决方案。