当机动车与非机动车发生碰撞事故，且责任被判定为各占50%时，赔偿的流程和原则可以归纳如下：

一、赔偿原则

在五五责任的情况下，双方均需对彼此所产生的相关损失承担50%的赔偿责任。这意味着，无论是机动车还是非机动车，都需要根据自身的责任比例来承担对方的损失。

二、赔偿流程

1. 交强险赔付：

   • 非机动车的损失首先由机动车的交通强制保险（交强险）在责任限额内进行赔付。
   • 如果非机动车的损失超过了交强险的责任限额，那么超出部分将由双方按照50%的比例共同承担。

2. 超出交强险部分的赔付：

   • 假设非机动车一方的损失为X万元，交强险赔付了Y万元（Y≤X），那么剩下的（X-Y）万元将由机动车方承担50%，即（X-Y）/2万元，非机动车方自行承担另外的50%。
   • 对于机动车一方的损失，非机动车同样需要承担50%的赔偿责任。

3. 商业险赔付：

   • 如果机动车一方购买了商业保险，那么机动车方所承担的那部分损失（在超出交强险责任限额后）可以由商业保险来进行赔付。

三、赔偿范围

赔偿的具体范围通常涵盖了多个方面，包括但不限于：

• 医疗费用：因事故导致的医疗救治费用。
• 护理费用：因受伤需要护理而产生的费用。
• 误工费用：因受伤无法工作而导致的收入损失。
• 交通费用：因治疗或处理事故而产生的交通费用。
• 营养费用：因受伤需要加强营养而产生的费用。
• 残疾赔偿金：如果事故导致受害者伤残，需要支付残疾赔偿金。
• 死亡赔偿金：如果事故导致受害者死亡，需要支付死亡赔偿金。

四、特殊情况处理

• 如果非机动车驾驶员存在故意碰撞机动车的行为，那么机动车一方可以免除赔偿责任。
• 在赔偿过程中，如果一方拒不履行赔偿责任，另一方可以通过法律途径来维护自身权益，如向法院提起诉讼。

五、定损问题

在赔偿过程中，定损是一个关键环节。双方需要共同确定损失的范围和金额，以确保赔偿的公正性。如果双方对定损结果有争议，可以寻求第三方评估机构的帮助。

综上所述，当机动车与非机动车发生碰撞事故且责任各占50%时，双方需要按照上述原则和流程进行赔偿。在处理过程中，建议双方保持冷静和理性，通过协商或法律途径来解决争议。