您好，关于您提出的“舅舅有案底是否会影响孩子上军校”的问题，我可以为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，军校的政治考核主要关注的是应征者本人的政治思想表现，以及其家庭成员、配偶的父母、未共同生活的兄弟姐妹中是否存在因危害国家安全行为受到刑事处罚，或者正在被侦查、起诉、审判的情况，以及是否组织、参加、支持民族分裂、暴力恐怖、宗教极端等非法组织，或是邪教、有害气功组织或者黑社会性质的组织成员。这些情况如果存在，那么考核结论可能会为“不通过”。

对于您提到的舅舅有案底的情况，根据《军队征集和招录人员政治考核规定》的相关内容，舅舅并不属于政治考核的直接对象。也就是说，舅舅的犯罪记录，除非涉及到上述的危害国家安全等严重情况（但您并未提及舅舅涉及此类情况），一般不会直接影响孩子报考军校的政治考核。

当然，最终的政治考核结论还需要由政治考核组依据有关规定和实际情况进行综合确定。但基于目前您提供的信息，舅舅的案底（除非涉及严重危害国家安全等情形）通常不会成为孩子报考军校的障碍。

因此，如果您的孩子其他方面都符合报考军校的条件，且舅舅的案底并不涉及严重危害国家安全等情形，那么他报考军校并希望通过政治考核应该是没有问题的。希望这个解答能够对您有所帮助。