在三个月哺乳期间，若男女双方协议抚养权归男方，法院在判决时会综合考虑协议的真实性与合法性，以及是否最有利于未成年子女的成长。以下是对此问题的详细分析：

1. 协议的真实性与合法性：

   • 法院首先会审查双方达成的抚养权协议是否真实、合法，是否系双方自愿且未受胁迫、欺诈等不正当手段影响。
   • 如果协议内容真实、合法，且双方均表示认可，那么法院会尊重双方的意愿。

2. 最有利于未成年子女的原则：

   • 尽管双方达成了协议，但法院在判决时仍需考虑是否最有利于未成年子女的成长。
   • 法院会评估男方的抚养能力、经济条件、生活环境等因素，以确保子女在男方的抚养下能够得到良好的成长环境。

3. 特殊情况的考量：

   • 如果女方存在严重疾病、未尽抚养义务或其他不利于子女成长的情况，且男方具备更好的抚养条件，那么法院在综合考虑后，更有可能支持双方的协议，将抚养权判给男方。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。但双方协议且不影响子女健康成长的，可以遵循双方协议。
   • 同时，《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》也明确了，在特定情况下，如女方患有严重疾病等，父亲请求直接抚养的，人民法院应予支持。

综上所述，在三个月哺乳期间，若男女双方协议抚养权归男方，法院在判决时会综合考虑协议的真实性与合法性，以及是否最有利于未成年子女的成长。如果协议内容真实、合法，且男方具备更好的抚养条件，法院有可能会支持双方的协议，将抚养权判给男方。但具体判决结果还需根据案件的具体情况和法院的综合考量来确定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。