物业不让业主新能源车进车库的行为是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
合法情况
基于管理规约与业主大会授权：
- 若小区业主大会通过的管理规约明确规定了车辆进出管理的相关规则，包括新能源车进出车库的限制，且物业是依据这些规定和业主大会的授权来执行，那么物业的限制行为通常是合法的。但这种情况较为少见，因为管理规约通常不会无故限制新能源车的进入。
存在安全隐患或特殊情况：
- 如果新能源车存在明显的安全隐患，如电池故障可能引发火灾等，且这种安全隐患是紧迫且现实的，物业出于公共安全考虑，有权暂时阻止该车辆进入车库。但这种情况需要物业有充分的证据证明安全隐患的存在，并且这种阻止行为应当是暂时的，一旦安全隐患消除，车辆应当被允许进入。
- 在特殊情况下，如车库内正在进行维修或改造，可能危及车辆安全，物业按照相关规定或提前公示通知后限制车辆进入，包括新能源车，也是合法的。
执行政府相关规定：
- 若政府部门出台了针对新能源车停放的特殊管理规定，如某些区域或时段禁止新能源车进入地下车库，物业按照规定执行限制车辆进入的措施，同样具有合法性。但这种情况需要政府有明确的规定，并且物业需要能够证明其执行的是政府的规定。
不合法情况
无故限制新能源车进入：
- 物业无故限制业主的新能源车正常进入车库，尤其是当业主已缴纳停车费或车库内有足够停车位时，这种行为侵犯了业主的合法权益，属于不合法行为。因为新能源车作为合法车辆，享有与其他车辆同等的进入车库的权利。
未遵循法定程序制定规则：
- 物业自行制定车辆进出管理规定，包括限制新能源车进入车库，但未经过合法的程序（如业主大会讨论通过），就以此为由限制车辆进入，缺乏合法性依据。因为管理规约的制定需要遵循法定的程序，确保业主的参与和同意。
构成消费歧视：
- 如果物业以新能源车存在安全隐患为由，禁止其进入地下车库，而地面上又没有为新能源车划分足够的停车位，或者划分了停车位但数量不足、位置不便等，导致新能源车无法正常停放，这种行为可能构成消费歧视。因为物业没有公平地对待所有车主，而是对新能源车车主设置了不合理的障碍。
业主应对措施
面对物业的不让新能源车进车库行为，业主可采取以下措施维护自己的权益：
- 沟通协商：首先与物业进行沟通协商，要求其说明理由并提供相关依据。如果物业的理由不充分或不合法，要求其立即纠正行为。
- 向业主委员会反映：若协商无果，可向小区业主委员会反映情况，寻求支持和帮助。业主委员会可以代表业主与物业进行协商或向相关部门投诉。
- 向相关部门投诉：若业主委员会无法解决问题，可向住建局等相关行政主管部门投诉或举报物业的违法行为。在投诉时，需要准备好相关证据和资料，如停车费缴纳凭证、车库停车位情况照片等，以便维权。
- 法律途径：在必要时，业主还可通过诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。可以起诉物业侵犯业主的物权或构成消费歧视等。
建议业主在遇到此类问题时，先了解自己的权益和法律法规的相关规定，再采取合适的措施来维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。