在机动车发生交通事故且责任划分为主次责任的情况下，住院费的赔偿通常遵循以下原则和流程：
一、责任比例划分
双方均为机动车：
- 主要责任方一般承担70%的赔偿责任。
- 次要责任方承担30%的赔偿责任。
一方为机动车，另一方为非机动车或行人：
- 机动车方负主要责任时，通常承担80%的赔偿责任。
- 机动车方负次要责任时，承担40%的赔偿责任。
二、赔偿流程
交强险赔付：
- 首先，由交强险在责任限额内进行赔付。交强险有医疗费用赔偿限额，该限额内费用由交强险全额承担。
超出交强险限额部分：
- 超出交强险医疗费用赔偿限额的部分，根据双方责任比例进行分担。
- 例如，若总医疗费为10万元，交强险医疗费用赔偿限额为1.8万元，则超出部分为8.2万元。若主要责任方承担70%，则需承担5.74万元；次要责任方承担30%，则需承担2.46万元。
商业险赔付：
- 若责任方购买了商业三者险，且保额足够，超出交强险部分将按责任比例由商业险赔付。
- 若保额不足，剩余部分由责任人自行承担。
三、理赔注意事项
及时就医并保留票据：
- 伤者应及时就医，并保留好所有医疗票据，包括诊疗费、药品费、住院费、手术费等，以便后续理赔计算。
通知保险公司：
- 事故发生后，责任方应及时通知保险公司，并按照保险公司要求提供相关证据和资料。
协商与诉讼：
- 双方可协商赔偿事宜，依据责任划分明确各自承担范围。
- 若协商不成，受害人可向法院起诉，要求责任方及保险公司承担赔偿责任。法院将依据事实和法律规定，确定双方责任比例及赔偿金额。
四、特殊情况处理
主要责任方不配合支付医疗费：
- 若主要责任方不配合支付医疗费，次要责任方或受害人可向法院起诉，要求主要责任方及保险公司承担赔偿责任。
次要责任方认为承担比例不合理：
- 若次要责任方认为承担比例不合理，可提供相关证据（如事故现场照片、证人证言等）向交警部门或法院提出异议，要求重新划分责任比例。
五、赔偿项目
赔偿项目不仅涵盖医疗费，还包括误工费、护理费、残疾赔偿金（伤残情况）、死亡赔偿金（致死情况）、财产损失等。各方应依据责任划分，就各自应承担部分进行赔偿。赔偿时需提供相关证据，如医疗票据、误工证明等，以确定具体赔偿金额。
综上所述，机动车发生交通事故主次责任下的住院费赔偿，需根据责任比例划分、交强险和商业险赔付流程进行。伤者应及时就医并保留票据，责任方应通知保险公司并配合提供证据。若协商不成，可通过诉讼解决。