结论前置：公司留存公章和法人手印作为印鉴，通常是为了确保文件签署的真实性、合法性及法律效力，同时防范法律风险。以下从不同角度详细说明：

1. 确保文件签署的真实性与合法性

• 公章的作用：公章是公司对外开展业务、签署合同等法律行为的法定标识，具有法律效力。留存公章印鉴可验证文件是否由公司正式出具，避免伪造或冒用。
• 法人手印的意义：法人手印（或签字）是法人代表个人身份的确认方式。在公章使用过程中，结合法人手印可进一步证明文件签署系法人真实意思表示，尤其在涉及重大合同或法律文件时，能增强文件的证明力。

2. 防范法律风险

• 内部管理需要：公司留存印鉴样本，可用于比对实际使用中的公章或法人签字是否一致，防止内部人员私刻公章、伪造文件等违规行为。
• 外部纠纷应对：若发生合同纠纷或法律争议，留存的印鉴可作为证据，证明公司签署文件的真实性，避免因印鉴问题导致合同无效或承担不利后果。

3. 符合法律法规要求

• 法定印鉴管理：根据《公司法》《民法典》等相关规定，公司公章的使用需符合内部管理程序，留存印鉴是规范用章流程的重要环节。
• 特定场景必要性：在银行开户、贷款、政府申报等场景中，机构可能要求提供公章及法人印鉴样本以备核验，确保业务合规。

4. 实际操作中的注意事项

• 印鉴保管安全：公章及法人印鉴应由专人保管，并建立使用登记制度，防止滥用或丢失。
• 变更及时更新：若公章或法人信息变更，需及时更新留存印鉴，避免使用过期或无效印鉴导致法律风险。

总结：公司留存公章和法人手印作为印鉴，是规范管理、防范风险的重要措施。若您对印鉴使用、合同签署或公司法律风险防范有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体场景为您提供详细解答。