关于同时中了两个标但放弃一个是否要扣保证金的问题，这主要取决于招标文件中的具体规定以及相关法律法规的适用情况。以下是从不同角度进行的分析：

1. 招标文件规定：

   • 若招标文件明确规定：在投标人同时中标多个标段但选择放弃其中一个时，需要扣除相应的保证金作为违约处罚，那么在这种情况下，放弃中标标段确实可能导致保证金的扣除。这是基于招标文件作为合同要约邀请，投标人响应并中标后，即与招标人形成了合同关系，放弃中标即构成违约。
   • 若招标文件未明确规定：或者规定较为模糊，没有直接提及放弃中标标段需要扣除保证金的情况，那么是否扣除保证金就需要依据相关法律法规以及双方协商的结果来确定。

2. 相关法律法规：

   • 《中华人民共和国招标投标法》：该法规定了招标投标活动的基本原则和程序，但对于放弃中标后保证金的处理并未作出具体规定。因此，在法律层面，并没有直接规定放弃中标必须扣除保证金。
   • 《中华人民共和国民法典》合同编：该编规定了合同的基本原则和履行、变更、解除等规则。在招标投标活动中，若投标人放弃中标，可能构成对招标人的违约，需要承担相应的违约责任。但违约责任的具体形式和范围，仍需依据合同（即招标文件）的约定来确定。

3. 实际操作建议：

   • 仔细阅读招标文件：在参与招标投标活动前，务必仔细阅读招标文件，了解其中关于保证金、违约责任等条款的具体规定。
   • 与招标人沟通：若在中标后确实需要放弃某个标段，建议及时与招标人进行沟通，说明情况并协商解决方案。在沟通中，可以提出自己的合理诉求，如是否可以部分退还保证金等。
   • 考虑法律后果：在决定放弃中标前，应充分考虑可能面临的法律后果，包括保证金的扣除、信用记录的受损等。这些后果可能对未来的招标投标活动产生不利影响。

总结来说，同时中了两个标但放弃一个是否要扣保证金，并没有一个统一的答案。它取决于招标文件中的具体规定以及双方协商的结果。因此，在面临这种情况时，建议投标人仔细阅读招标文件、与招标人进行充分沟通，并考虑可能的法律后果后再做出决定。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。