支付宝协商还款后扣款，应首先核对扣款是否符合协商内容，如不符可联系支付宝客服协商处理。具体分析如下：

一. 核对扣款是否符合协商内容

• 你在与支付宝协商还款时，双方应会明确还款金额、还款期限以及扣款方式等具体细节。扣款后，首先应核对扣款金额、时间等是否与协商内容一致。
• 如果扣款符合协商内容，那么这是正常的还款流程，无需进一步处理。

二. 联系支付宝客服协商处理

• 如果扣款不符合协商内容，或者你认为扣款有误，应立即联系支付宝客服，说明情况并提出异议。
• 提供相关证据，如协商还款的聊天记录、扣款记录等，以支持你的主张。
• 与支付宝客服进行协商，看是否能够退回误扣的款项，或者调整还款计划以符合双方的实际情况。

三. 法律依据

• 虽然支付宝的扣款行为主要基于双方的协商和支付宝的用户协议，但《中华人民共和国民法典》第六百七十五条关于借款人应按约定期限返还借款的规定，以及《中华人民共和国民事诉讼法》第九十九条关于调解协议自愿、合法的原则，同样适用于此类情况。
• 如果与支付宝无法协商一致，你可以考虑通过法律途径维护自己的权益，但这一步应谨慎考虑，因为诉讼可能涉及时间和成本。

我建议，在与支付宝协商还款时，务必确保双方对还款计划有明确的了解，并保留好所有相关的聊天记录和文件。如遇扣款问题，及时与支付宝客服沟通，并准备好相关证据以支持你的主张。如有进一步需要，您可以继续咨询我。