土地证上标注的基本农田，可以作为行政诉讼中的依据，但其证明力及具体应用需结合案件事实和法律规定综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、土地证的法律效力
土地证是土地权利人依法享有土地使用权或所有权的法律凭证。当土地证上明确标注为“基本农田”时，这一标注具有法律效力，能够证明该土地属于基本农田范畴。在行政诉讼中，土地证作为书证，其真实性、合法性和关联性通常会被法院所认可，从而成为认定案件事实的重要依据。
二、基本农田的特殊保护
根据《中华人民共和国土地管理法》和《基本农田保护条例》等相关法律法规，基本农田受到严格保护，禁止擅自改变用途或进行非农建设。若行政机关作出的行政行为涉及基本农田，且该行为与土地证上的标注相冲突，那么土地证上的标注将成为质疑行政行为合法性的有力证据。
三、行政诉讼中的具体应用
作为证据提交：
- 在行政诉讼中，您可以将土地证作为证据提交给法院，以证明涉案土地为基本农田。
- 法院将根据土地证的真实性、合法性和关联性，结合其他证据，综合判断行政行为的合法性。
结合其他证据使用：
- 土地证虽为重要证据，但并非唯一证据。在行政诉讼中，您可能还需要提供其他证据，如现场照片、视频资料、证人证言等，以形成完整的证据链。
- 例如，若行政机关以“非基本农田”为由批准了某项建设，而您能提供土地证及现场照片证明该土地实际为基本农田，那么这将大大增强您诉讼主张的说服力。
注意证据的完整性和真实性：
- 在提交土地证作为证据时，需确保其真实性和完整性。若土地证存在涂改、伪造等情形，将可能影响其证明力。
- 同时，您还需注意土地证的保管和提交方式，避免因保管不善或提交不当而导致证据失效。
四、可能的法律后果
若行政行为违法：
- 若法院认定行政机关作出的行政行为违反了基本农田保护的相关规定，那么该行政行为可能会被撤销或确认违法。
- 在此情况下，您作为土地权利人，有权要求行政机关恢复土地原状或赔偿损失。
若行政行为合法：
- 若法院认定行政机关作出的行政行为符合法律规定，且未侵犯您的合法权益，那么您的诉讼主张可能会被驳回。
- 但在此情况下，您仍可通过其他途径（如行政复议、信访等）寻求救济。
五、建议与注意事项
及时咨询专业律师：
- 行政诉讼涉及复杂的法律程序和实体问题，建议您在诉讼前及时咨询专业律师，以获取针对性的法律建议。
充分准备证据：
- 在行政诉讼中，证据的充分性和真实性至关重要。建议您在诉讼前充分准备证据，确保证据的完整性和真实性。
注意诉讼时效：
- 行政诉讼具有诉讼时效的限制，建议您在知道或应当知道行政行为之日起六个月内提起诉讼，以免丧失诉讼权利。
如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。