若企业在县道上设卡且经依法通知后仍不自行拆除，将面临行政处罚，具体处罚措施需根据违法情节的严重程度确定。以下是详细分析：
一、法律依据与违法性质
根据《中华人民共和国公路法》第四十四条、第四十五条及第七十九条，任何单位或个人不得擅自占用、挖掘公路，或进行其他影响公路畅通的活动。企业在县道上设卡，属于未经许可擅自设置障碍物，阻碍交通的行为，违反了公路管理法规，构成行政违法。
二、处罚措施
责令限期拆除：
- 公路管理机构或交通主管部门在发现企业设卡行为后，会首先责令企业限期自行拆除障碍物，恢复公路畅通。
罚款：
- 若企业未在规定期限内自行拆除，公路管理机构将依法处以罚款。罚款金额根据违法情节的严重程度确定，一般处以三万元以下的罚款。
- 具体罚款数额可能因地区、违法时间、影响范围等因素而有所不同。
强制拆除：
- 在责令限期拆除且企业未履行的情况下，公路管理机构有权采取强制措施，拆除障碍物，所需费用由企业承担。
其他法律责任：
- 若设卡行为导致交通事故或造成其他严重后果，企业还可能承担民事赔偿责任，甚至面临刑事责任追究。
三、处理流程
发现与调查：
- 公路管理机构或交通主管部门在巡查中发现企业设卡行为，或接到相关举报后，将进行调查核实。
责令改正：
- 确认违法事实后，将向企业发出责令改正通知书，要求限期拆除障碍物。
处罚决定：
- 若企业未在规定期限内改正，公路管理机构将依法作出处罚决定，包括罚款和强制拆除等措施。
执行与监督：
- 处罚决定作出后，公路管理机构将监督企业执行处罚决定，确保公路畅通。
四、建议与提醒
- 企业应遵守公路管理法规，不得擅自设卡或进行其他影响公路畅通的活动。
- 若已设卡，应立即自行拆除，避免面临更严重的法律后果。
- 如对处罚决定有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。
企业在县道上设卡且不自行拆除的行为，将面临行政处罚，包括罚款和强制拆除等措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。