针对您提出的“未按规定编制采购文件怎么处理代理机构”的问题，这主要涉及到政府采购过程中代理机构的违规行为及其相应的法律责任。以下是根据相关法律法规的详细解答：
一、法律依据
首先，我们需要明确的是，政府采购活动受到《中华人民共和国政府采购法》及其实施条例的严格规范。这些法律法规对采购人、采购代理机构在政府采购过程中的行为进行了详细规定，并设定了相应的法律责任。
二、违规行为及法律责任
对于采购代理机构未按规定编制采购文件的行为，根据《中华人民共和国政府采购法》第七十一条和第七十八条，以及《中华人民共和国政府采购法实施条例》的相关规定，可能构成以下违规行为之一：
未依照政府采购法和本条例规定的方式实施采购：这包括未按规定编制采购文件，如未明确采购需求、评审标准等关键信息。
其他相关违规行为：如未依法在指定的媒体上发布政府采购项目信息、未按照规定执行政府采购政策等，这些也可能间接影响到采购文件的编制和发布。
对于上述违规行为，法律设定了以下法律责任：
责令限期改正：财政部门有权要求代理机构在规定期限内改正其违规行为。
给予警告：对代理机构的违规行为进行公开警告，以示惩戒。
罚款：根据违规情节的严重程度，财政部门可以对代理机构处以罚款，罚款数额根据具体法律法规确定，如《中华人民共和国政府采购法实施条例》第六十六条规定，政府采购法第七十一条规定的罚款数额为10万元以下。
禁止代理政府采购业务：对于情节严重的违规行为，财政部门可以在一至三年内禁止该代理机构代理政府采购业务。
追究刑事责任：如果代理机构的违规行为构成犯罪，如与供应商恶意串通、接受贿赂等，将依法追究其刑事责任。
三、处理流程
当财政部门发现采购代理机构存在未按规定编制采购文件的行为时，通常会按照以下流程进行处理：
立案：对违规行为进行审查，决定是否立案调查。
调查：指定专人负责调查取证，确保调查过程的公正性和客观性。
审查：对调查报告进行审查，提出处理意见。
告知：在作出行政处罚决定前，告知代理机构其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。
决定：制作行政处罚决定书，明确处罚种类和幅度。
送达：将行政处罚决定书依法送达代理机构。
四、建议与预防
为了避免类似违规行为的发生，建议采购代理机构：
加强内部管理：建立健全的政府采购内部管理制度，确保采购活动的合规性。
提高专业水平：加强对政府采购法律法规的学习和培训，提高从业人员的专业素养。
强化风险意识：增强风险防范意识，及时发现并纠正潜在的违规行为。
综上所述，对于采购代理机构未按规定编制采购文件的行为，财政部门将依法进行处罚，包括责令限期改正、给予警告、罚款、禁止代理政府采购业务以及追究刑事责任等。同时，建议采购代理机构加强内部管理、提高专业水平并强化风险意识，以避免类似违规行为的发生。