命案积案证据不全的案子，需要根据诉讼阶段的不同采取不同的处理措施。

一. 在检察院审查起诉阶段

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十一条和第一百七十五条的规定，若案件事实不清，证据不足，人民检察院将依据案件的具体情况作出相应的处理：

1. 补充侦查：人民检察院可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料，也可以自行侦查。对于需要补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕，且补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

2. 作出不起诉决定：如果经过二次补充侦查，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

二. 在人民法院审理阶段

若案件进入审判阶段，法院在审理过程中发现事实不清，证据不足，将依据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百条的规定及无罪推定原则进行处理：

• 无罪判决：根据无罪推定原则，即“凡受刑事控告者，在未依法证实有罪之前应当视为无罪”，以及“谁主张，谁举证”的诉讼原则，如果证据不充分，事实不清楚，使被告人是否有罪处于不能证实的悬疑状态，法院应当作出有利于被告人的无罪判决。

三. 针对命案积案证据不全的特殊情况

命案积案由于案发时间久远，往往具有客观证据薄弱、取证不规范、补查补证难度大、言词证据易变化等特点。对于这类案件，我建议：

1. 坚持物证全面审查原则：检察机关应尽可能收集有价值的证据，加强对原有证据的补强完善，发现和拓展新证据。

2. 加强侦检协作：确保检察机关及时掌握案情，为公安机关提供详细的指导意见，共同构建完善的证据体系。

3. 注重证据的综合分析：在审查证据时，要注重将静态证据向动态证据转化，孤立证据向整体证据转化，通过综合分析判断，尽可能还原案件事实。

总结：对于命案积案证据不全的案子，关键在于通过补充侦查、加强侦检协作、注重证据综合分析等方式，努力完善证据体系。在审查起诉和审判阶段，应严格遵循法律规定，确保案件得到公正处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。