醉酒第三次驾驶电动三轮车，检查院是否会起诉，需根据具体情况判断，但通常情况下，醉酒驾驶机动车是违法行为，检查院很可能会提起公诉。下面我将对此进行详细分析：

一. 醉酒驾驶的法律规定

1. 醉酒驾驶的定义：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，醉酒驾驶是指驾驶人员血液中的酒精含量超过一定标准（通常为80mg/100ml）的驾驶行为。

2. 醉酒驾驶的处罚：醉酒驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门约束至酒醒，吊销机动车驾驶证，依法追究刑事责任；五年内不得重新取得机动车驾驶证。这表明，醉酒驾驶是严重的违法行为，将受到严厉的刑事处罚。

3. 电动三轮车的性质：电动三轮车在法律上通常被视为机动车的一种，因此，醉酒驾驶电动三轮车同样适用上述法律规定。

二. 第三次醉酒驾驶的影响

1. 重复违法的严重性：第三次醉酒驾驶表明驾驶人员有严重的违法倾向和交通安全意识淡薄，这可能会加重其法律责任。

2. 检查院的起诉决定：检查院在决定是否起诉时，会综合考虑案件的具体情况，包括驾驶人员的酒精含量、驾驶行为、前科记录等。在第三次醉酒驾驶的情况下，检查院很可能会认为驾驶人员具有较大的社会危害性，从而提起公诉。

三. 实际案例的参考

• 在实际案例中，醉酒驾驶电动三轮车被检查院提起公诉并判处刑罚的情况并不罕见。这些案例表明，醉酒驾驶电动三轮车同样会受到法律的严惩。

综上所述，醉酒第三次驾驶电动三轮车是严重的违法行为，检查院很可能会提起公诉。我建议驾驶人员应严格遵守交通安全法规，切勿酒后驾车，以免给自己和他人带来严重的法律后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。