结论：施工区不一致导致综合单价不一致，在符合合同约定和法律规定的情况下是可以的，但需要满足一定条件并遵循相应规则。以下从不同角度进行分析：

合同约定角度

1. 有明确约定：如果施工合同中已经明确约定了不同施工区域可以采用不同的综合单价，并且详细说明了划分不同施工区域的标准以及对应综合单价的确定方式，那么施工区不一致时综合单价不一致是符合合同约定的，是合法有效的。例如，合同中规定A区域由于地质条件复杂，施工难度大，综合单价为每立方米500元；B区域地质条件较好，施工难度低，综合单价为每立方米300元。在这种情况下，只要实际施工情况与合同约定的区域划分和单价标准相符，就是合理的。
2. 无明确约定：若合同中没有对不同施工区域的综合单价作出明确约定，当出现施工区不一致导致综合单价争议时，就需要依据相关法律规定和行业惯例来处理。一般来说，此时需要双方协商确定合理的综合单价。如果协商不成，可能会通过工程鉴定等方式来确定单价，以确保公平合理。

法律规定角度

1. 公平原则：根据《中华人民共和国民法典》的公平原则，民事主体从事民事活动，应当遵循公平原则，合理确定各方的权利和义务。在施工合同中，如果不同施工区域的工作量、施工难度、资源消耗等存在明显差异，采用不同的综合单价是符合公平原则的。例如，一个项目中，山区施工区域需要更多的爆破作业、运输成本也更高，而平原施工区域则相对简单，那么对这两个区域采用不同的综合单价是合理的，能够体现双方权利义务的对等。
2. 诚实信用原则：双方当事人在签订和履行施工合同过程中，应当遵循诚实信用原则。如果一方故意隐瞒施工区域的实际情况，或者在不合理的条件下要求调整综合单价，就违反了诚实信用原则。例如，承包方在投标时故意低估某些施工区域的难度，以低价中标，然后在施工过程中以各种理由要求提高这些区域的综合单价，这种行为是不被允许的。

实际操作角度

1. 工程量清单计价规范：在采用工程量清单计价的工程项目中，综合单价的确定需要遵循相关的计价规范。如果不同施工区域的工程内容、项目特征等在工程量清单中有明确的区分，并且对应不同的综合单价，那么在实际施工中按照清单执行是合理的。例如，工程量清单中分别列出了基础开挖的不同土质区域，并给出了相应的综合单价，施工时按照实际土质情况套用对应的单价即可。
2. 变更情况处理：在施工过程中，如果由于设计变更等原因导致施工区域发生变化，从而影响综合单价，需要按照合同约定的变更程序来处理。一般来说，承包方需要及时提出变更申请，说明变更的原因、对综合单价的影响等内容，经发包方审核确认后，按照新的综合单价执行。例如，原设计中的某个施工区域由于规划调整，需要扩大施工范围或者改变施工方式，此时就需要重新确定该区域的综合单价。

建议：在实际施工中，为了避免因施工区不一致导致综合单价不一致而产生纠纷，双方在签订合同时应当尽可能详细地约定不同施工区域的划分标准和综合单价的确定方式；在施工过程中，要严格按照合同约定和相关规定执行，如有变更及时办理相关手续。如果你还有其他关于施工合同方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。