对方电瓶车闯红灯撞伤您的机动车，且对方不承认闯红灯的情况下，您应立即报警，由交警出具交通事故责任认定书来明确责任。以下是详细的分析和建议：
一、立即报警并保护现场
在发生交通事故后，无论对方是否承认闯红灯，您都应立即报警。报警后，交警会迅速赶到现场进行勘查，记录事故情况，包括车辆位置、刹车痕迹、目击者信息等。这些勘查记录对于后续的责任认定至关重要。
二、交警出具交通事故责任认定书
责任认定过程：交警在勘查现场后，会根据当事人的行为对发生交通事故所起的作用以及过错的严重程度，确定当事人的责任。如果对方确实闯红灯，交警会在责任认定书中明确这一点。
责任认定书的作用：交通事故责任认定书是对方无法否认的责任凭证。即使对方不承认闯红灯，有了这份认定书，您也可以在法律上确保其承担相应的责任。此外，责任认定书还是交通警察对违章当事人进行行政处罚的依据，以及在交通肇事刑事案件与民事赔偿案件中，证明被告人是否有罪、赔偿义务人是否承担民事赔偿责任以及赔偿数额的重要证据。
三、后续处理流程
调解与诉讼：对于交通事故损害赔偿的争议，您不仅可以请求公安机关交通管理部门进行调解，还可以直接选择向人民法院提起民事诉讼。如果经公安机关交通管理部门调解后，当事人未能达成协议，或者调解书生效后对方不履行，您同样有权向人民法院提起民事诉讼，以法律手段维护自己的合法权益。
申请强制执行：如果判决的履行义务人在规定期限内未履行赔偿义务，您可以向人民法院申请强制执行，以确保自己的合法权益得到最终实现。
四、特殊情况处理
对方逃逸：如果对方在事故发生后逃逸，您更应立即报警。交警会通过调取监控录像、询问目击者等方式，尽力查找逃逸者。一旦找到逃逸者，其将承担事故的全部责任。
证据收集：在等待交警到来的过程中，您可以尽量收集现场证据，如拍照、录像、记录目击者联系方式等。这些证据在后续的责任认定和诉讼过程中可能起到关键作用。
总结与建议：面对对方电瓶车闯红灯撞伤您的机动车且不承认的情况，您应保持冷静，立即报警并保护现场。等待交警到来后，配合其进行勘查和调查工作。一旦交警出具交通事故责任认定书，您就可以根据认定书的结果来维护自己的合法权益。如果对方不履行赔偿义务，您可以向人民法院提起民事诉讼并申请强制执行。在整个过程中，如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。