合同签署时，法人签字盖在公章内，从法律效力的角度而言，通常并不影响合同的成立与生效，但需结合具体合同约定及交易习惯来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律效力层面
公章与法人签字的法律效力：
- 公章作为法人单位的正式印鉴，具有代表法人意志的法律效力。在合同上加盖公章，即视为法人对合同内容的认可和确认。
- 法人签字同样具有法律效力，代表法人对合同内容的直接确认。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。因此，无论是公章还是法人签字，都能单独作为合同成立的要件。
签字盖在公章内的法律效力：
- 签字盖在公章内，并不改变签字和公章本身的法律效力。只要签字和公章都是真实、合法的，且能够清晰辨认，那么这种签署方式在法律上就是有效的。
- 然而，需要注意的是，如果签字被公章完全覆盖，导致签字无法辨认，那么可能会引发关于签字真实性的争议。因此，在实际操作中，应尽量避免签字被公章完全覆盖的情况。
二、合同约定与交易习惯层面
合同约定：
- 如果合同中明确规定了签署方式，如“必须法人签字并加盖公章”，那么应严格按照合同约定执行。在这种情况下，如果法人签字盖在了公章内，但合同并未明确禁止此种签署方式，且双方对此无异议，那么合同仍然有效。
- 如果合同对签署方式有特别要求，而实际签署方式与之不符，那么可能会引发合同效力方面的争议。因此，在签署合同时，应仔细阅读合同条款，确保签署方式符合合同约定。
交易习惯：
- 在某些行业或交易场景中，可能存在特定的交易习惯或惯例。例如，某些行业可能更倾向于使用法人签字加盖公章的双重确认方式，以增强合同的确定性和可信度。
- 如果交易习惯或惯例对签署方式有明确要求，那么应遵循这些要求来签署合同。否则，可能会因不符合交易习惯或惯例而引发争议。
三、实际操作建议
确保签字和公章的清晰可辨：
- 在签署合同时，应确保法人签字和公章都清晰可辨。如果可能的话，应避免将签字盖在公章内，以减少因签字无法辨认而引发的争议。
遵循合同约定和交易习惯：
- 在签署合同时，应仔细阅读合同条款，了解合同对签署方式的具体要求。同时，也应考虑交易习惯或惯例对签署方式的影响。
保留签署记录：
- 为了便于后续查验和证明之用，建议在使用公章和法人签字的同时保留一份签署记录的复印件或扫描件。这不仅有助于维护合同的完整性，还能在必要时提供有力的证据支持。
总结来说，合同签署时法人签字盖在公章内，在法律上通常并不影响合同的成立与生效。但为了避免潜在的争议和风险，建议在实际操作中遵循合同约定和交易习惯，确保签字和公章的清晰可辨，并保留好签署记录。如果您在合同签署方面遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询。