单位借给职工的房屋协议，在符合法律规定和双方真实意愿的情况下，是有效的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、协议有效的法律基础
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权按照自己的意愿依法设立、变更、终止民事法律关系。单位与职工之间就房屋借用事宜达成的协议，只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，即具有法律效力。
房屋借用协议的性质：房屋借用协议属于无名合同，即法律未明确规定其名称和内容的合同。但无名合同同样受法律保护，只要其符合合同生效的一般要件，即具有法律效力。
二、协议有效的具体条件
双方主体适格：单位应具有合法的房屋所有权或使用权，且有权将房屋借给职工使用；职工应具有完全民事行为能力，能够独立承担民事责任。
意思表示真实：双方签订协议时，应确保意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。
内容合法合规：协议内容应合法合规，不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得违反房屋管理、土地管理等相关法律法规。
形式要件：虽然房屋借用协议并非必须采用书面形式，但为了明确双方权利义务，避免纠纷，建议采用书面形式签订协议。
三、可能影响协议效力的情形
违反法律、行政法规的强制性规定：如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，如未经批准擅自改变房屋用途等，则协议可能无效。
违背公序良俗：如果协议内容违背了公序良俗，如以不正当手段获取房屋借用权等，则协议也可能无效。
存在欺诈、胁迫等情形：如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方意思表示不真实，则受损害方有权请求撤销协议。
四、法律建议
签订书面协议：为了明确双方权利义务，避免纠纷，建议单位与职工签订书面房屋借用协议，并详细约定借用期限、借用费用（如有）、房屋使用要求、违约责任等内容。
遵守法律法规：双方在签订和履行协议过程中，应严格遵守相关法律法规，确保协议内容合法合规。
及时处理纠纷：如果双方在履行协议过程中发生纠纷，应及时协商解决；协商不成的，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。
总结：单位借给职工的房屋协议在符合法律规定和双方真实意愿的情况下是有效的。但为了确保协议的有效性和避免纠纷，建议双方签订书面协议并遵守相关法律法规。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。