被告对中院指定审理的案件提管辖权异议，法院通常不会支持该异议，案件仍会由中院继续审理，但具体处理需依据法律规定和案件实际情况。以下从不同角度进行详细分析：
一、管辖权异议的法律规定与中院指定审理的效力
管辖权异议的法定条件：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人提出管辖权异议，应当在提交答辩状期间提出，且异议需基于受诉法院对案件无管辖权这一法定理由。
- 若中院已依法指定审理某案件，则意味着该中院已获得对案件的管辖权，此时被告再提管辖权异议，通常不符合法定条件。
中院指定审理的效力：
- 中院作为上级法院，其指定审理的决定具有法律效力，下级法院及当事人均应遵守。
- 被告对中院指定审理的案件提管辖权异议，实际上是对中院指定审理决定的否定，这在法律上是不被允许的。
二、法院对管辖权异议的处理方式
审查异议的合法性：
- 法院在收到被告的管辖权异议申请后，会首先审查异议的合法性，包括异议是否在规定时间内提出、异议理由是否充分等。
- 对于中院已指定审理的案件，法院通常会认定被告的管辖权异议不成立，因为中院的指定审理决定已明确了管辖法院。
裁定驳回异议：
- 若法院经审查认为被告的管辖权异议不成立，会依法裁定驳回异议，案件继续由中院审理。
- 裁定驳回后，被告若不服，可在规定期限内向上一级法院提起上诉，但上诉通常不会改变中院对案件的管辖权。
三、被告提管辖权异议的可能后果与应对建议
可能后果：
- 被告提管辖权异议若被驳回，可能会面临法院对其行为的不利评价，甚至可能影响其在后续诉讼中的信誉和地位。
- 若被告恶意提管辖权异议以拖延诉讼，法院可能会对其采取相应的制裁措施，如罚款、拘留等。
应对建议：
- 被告在提管辖权异议前，应充分评估异议的合法性和合理性，避免盲目提异议。
- 若被告确实认为案件应由其他法院管辖，可尝试通过与原告协商、申请法院移送管辖等方式解决，而非直接提管辖权异议。
- 在诉讼过程中，被告应积极配合法院的审理工作，遵守诉讼程序，以维护自身的合法权益。
四、特殊情况下的处理
- 若中院指定审理存在违法情形：
- 虽然这种情况较为罕见，但若中院在指定审理过程中存在违法情形（如违反级别管辖、专属管辖等规定），被告可依法向有关机关提出申诉或举报。
- 在此情况下，被告的管辖权异议可能会得到法院的支持，案件可能会被移送至有管辖权的法院审理。但这种情况需要被告提供充分的证据证明中院指定审理存在违法情形。