迟到扣工资是否违法，不能一概而论，而是需要看用人单位的规章制度是否合法、合规，以及扣减工资的行为是否合理。以下从不同角度为您详细分析：

一、规章制度需合法制定并公示

根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如劳动报酬、工作时间等）时，必须经过职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。此外，这些规章制度还必须向劳动者进行公示或告知。如果用人单位的规章制度未经上述民主程序制定，或者未向劳动者公示，那么基于这样的规章制度扣减员工工资将是违法的。

举例：假设某公司未经过职工代表大会讨论，也未向员工公示，就擅自制定了迟到扣工资的规章制度，并据此扣减了员工的工资，这种行为就是违法的。

二、扣工资数额需合理

即便用人单位有了合法的规章制度，扣减工资的行为也必须在合理的范围内进行。根据《工资支付暂行规定》，因劳动者个人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可以要求其赔偿，但扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。对于仅仅是迟到而未给单位造成实际经济损失的情况，如果扣除了较大比例的工资（如当天甚至几天的工资），这显然是不合理的，也属于违法行为。

举例：如果员工当月工资为5000元，因迟到被扣除了1500元（超过当月工资的20%），且扣除后的工资低于当地月最低工资标准，那么这种扣减行为就是违法的。

三、合法合规的规章制度下扣工资是合法的

如果用人单位的规章制度是经过合法程序制定，内容合法且不违反公序良俗，并已向劳动者进行了公示或告知，同时关于迟到扣工资的规定也是合理的（如规定迟到一次扣除适当金额，且不会对劳动者的基本生活造成严重影响），那么在这种情况下，用人单位根据规章制度对迟到员工扣减工资就是合法的。

举例：某公司经过职工代表大会讨论，制定了迟到扣工资的规章制度，并明确规定迟到一次扣除50元，且扣除后的工资不低于当地月最低工资标准。该规章制度已向员工公示，那么在这种情况下，公司根据规章制度对迟到员工扣减工资就是合法的。

四、建议与总结

1. 劳动者：在入职前务必仔细了解用人单位的规章制度，特别是关于劳动报酬和考勤管理的部分。在遇到扣工资问题时，也应及时向我咨询，以维护自己的合法权益。
2. 用人单位：应确保自己的规章制度符合法律法规的要求，避免因此引发不必要的劳动纠纷。同时，在制定规章制度时，应充分考虑员工的实际情况和合理需求，确保规章制度的合理性和可行性。

综上所述，迟到扣工资是否违法，需要综合考虑用人单位的规章制度是否合法、合规，以及扣减工资的行为是否合理。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。