已还款项在符合法律规定和合同约定的情况下，是可以抵扣逾期利息的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律规定角度
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款人应当按照约定的期限支付利息。对支付利息的期限没有约定或者约定不明确，依照法律规定仍不能确定的情况下，借款期间不满一年的，应当在返还借款时一并支付；借款期间一年以上的，应当在每届满一年时支付，剩余期间不满一年的，应当在返还借款时一并支付。同时，如果借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。
在法律层面，并没有直接规定已还款项必须或不能抵扣逾期利息，但根据公平原则和合同履行原则，如果借款人已经偿还了部分款项，且这部分款项在合同中没有明确指定为偿还本金或利息，那么在双方没有争议或法院判决的情况下，可以视为优先偿还利息（包括逾期利息），剩余部分再偿还本金。当然，这需要根据具体合同条款和实际情况来判断。
二、合同约定角度
明确约定：如果借款合同中明确约定了已还款项的抵扣顺序（如先抵扣利息，再抵扣本金），那么应当按照合同约定执行。这种情况下，已还款项自然可以抵扣逾期利息。
未明确约定：如果借款合同中没有明确约定已还款项的抵扣顺序，那么根据交易习惯和公平原则，可以认为已还款项应当优先用于抵扣利息（包括逾期利息）。但这一原则并非绝对，如果双方对此有争议，可能需要通过诉讼或仲裁来解决。
三、实际操作角度
双方协商：在实际操作中，如果借款人已经偿还了部分款项，且希望这部分款项能够抵扣逾期利息，可以与出借人进行协商。如果出借人同意，那么双方可以签订补充协议或进行其他形式的确认。
诉讼或仲裁：如果双方无法就已还款项的抵扣问题达成一致意见，那么借款人或出借人可以向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构会根据合同条款、法律规定以及实际情况来判断已还款项是否可以抵扣逾期利息。
四、特殊情况
预扣利息：如果出借人在出借款项时已经预扣了利息（即借款人实际收到的款项少于合同约定的借款金额），那么在这种情况下，已还款项应当首先用于偿还实际收到的借款本金和按照实际借款金额计算的利息（包括逾期利息）。
复利计算：如果借款合同中约定了复利计算方式（即利息上产生利息），那么已还款项在抵扣利息时可能需要按照复利计算的方式来确定抵扣金额。但需要注意的是，复利计算方式必须符合法律规定和合同约定，否则可能不会被法院或仲裁机构认可。
建议：在处理已还款项抵扣逾期利息的问题时，建议您首先仔细审查借款合同中的相关条款，了解双方的权利和义务。如果合同中有明确约定，则按照合同约定执行；如果合同中没有明确约定，则可以与出借人进行协商或寻求法律途径解决。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。