要确认公司是否已经通过劳动行政部门办理了不定时工作制的审批手续，您可以按照以下步骤进行查询和确认：
一、了解审批依据和流程
首先，根据《中华人民共和国劳动法》第三十九条以及《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》（劳部发〔1994〕503号）等相关规定，企业因生产特点不能实行标准工时制度的，需经劳动行政部门批准，方可实行不定时工作制。审批流程通常包括企业提交申请材料、劳动行政部门审核、作出准予或不予受理的决定等环节。
二、查询公司审批情况
直接询问公司人力资源部门： 最直接的方式是向公司的人力资源部门或负责工时制度管理的部门咨询。他们应该能够提供关于公司是否已申请并获得不定时工作制审批的详细信息。
查阅公司内部文件或公告： 公司可能会在内部发布关于工时制度调整的公告或文件，其中可能包含不定时工作制审批的相关信息。您可以查阅公司内部的公告栏、电子邮件或内部网站等渠道。
联系当地劳动行政部门： 如果公司内部无法提供确切信息，您可以联系公司所在地的劳动行政部门（如人力资源和社会保障局）进行查询。在查询时，您需要提供公司的名称、注册地址等基本信息，以便劳动行政部门能够准确查找相关审批记录。
三、确认审批材料和内容
如果公司已经获得了不定时工作制的审批，您可以进一步要求查看审批材料，以确认审批的具体内容和范围。审批材料通常包括企业非标准工时制审批表、企业非标准工时制实施方案、职工代表大会会议记录等。通过查看这些材料，您可以了解公司哪些岗位或工种被批准实行不定时工作制，以及审批的有效期限等信息。
四、关注后续管理和监督
即使公司已经获得了不定时工作制的审批，也需要关注其后续的管理和执行情况。根据相关规定，企业应当将劳动保障行政部门的批准决定在单位内公示，并在劳动合同中明确实行的工种及人员。同时，企业还需要建立实行不定时工作制的登记存档制度，确保劳动者的权益得到保障。
五、法律途径
如果您对公司的不定时工作制审批情况存在疑虑或发现公司存在违规行为，您可以通过法律途径进行维权。例如，您可以向当地劳动监察部门投诉或举报公司的违规行为，或者通过劳动争议仲裁机构解决与公司的劳动争议。
综上所述，要确认公司是否已经通过劳动行政部门办理了不定时工作制的审批手续，您可以通过直接询问公司人力资源部门、查阅公司内部文件或公告、联系当地劳动行政部门进行查询等方式进行确认。同时，也需要关注公司后续的管理和执行情况，确保劳动者的权益得到保障。