鉴定材料书面质证意见中，当然可以写“不同意”。这是当事人在法律程序中表达自身观点、维护自身权益的重要方式。下面，我将从几个角度详细解释这个问题：
一、法律权利与程序要求
根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第三十七条，当事人对鉴定书的内容有异议的，应当在人民法院指定期间内以书面方式提出。这意味着，如果你对鉴定材料或鉴定意见有不同看法，你完全有权在书面质证意见中明确表达“不同意”的态度。这是法律赋予你的权利，也是确保司法公正的重要环节。
二、表达异议的具体情形
鉴定主体资格问题：如果你认为鉴定主体不具备相应的鉴定资格，比如鉴定机构或鉴定人没有合法的资质证书，你可以在书面质证意见中提出异议，并说明理由。
鉴定程序违法：如果你发现鉴定程序存在严重违法的情况，比如鉴定过程中没有遵循规定的步骤或方法，你也可以在书面质证意见中指出，并表达你的不同意见。
鉴定结论依据不足：如果你认为鉴定结论明显依据不足，比如鉴定所依据的原理、方法不科学，或者鉴定过程中没有充分考虑相关因素，你同样可以在书面质证意见中提出异议。
其他情形：除了上述情形外，如果你认为鉴定结论经过质证不能作为证据使用，或者存在其他影响鉴定结论公正性的因素，你也可以在书面质证意见中明确表达你的不同意见。
三、表达异议后的法律后果
当你提出书面质证意见并表达“不同意”后，人民法院会要求鉴定人作出解释、说明或者补充。如果鉴定人无法给出合理的解释或补充，或者人民法院认为有必要，可能会要求鉴定人出庭接受质询。在这个过程中，你有权继续表达你的观点，并维护你的合法权益。
四、建议与注意事项
及时提出异议：一定要在人民法院指定的期间内提出书面质证意见，否则可能会丧失提出异议的权利。
明确异议理由：在书面质证意见中，要明确表达你的不同意见，并给出具体的理由和依据。这样有助于人民法院更好地理解你的立场，并作出公正的裁决。
保持理性与客观：在表达异议时，要保持理性与客观的态度。不要因为情绪激动而说出过激的话，或者提出没有依据的异议。这样有助于维护你的形象，并增加你的异议被采纳的可能性。
如果你在鉴定材料书面质证意见方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。