监理罚款5000元的处理需结合罚款主体、性质及程序合法性综合判断，具体分以下情况处理：

1. 若罚款主体为行政机关（如住建部门）

   • 合法性审查：需确认罚款是否依据《建设工程质量管理条例》《安全生产法》等法律法规作出，且罚款金额是否在法定幅度内（如《建设工程质量管理条例》第58条对监理单位违规的罚款上限为50万元，5000元属合理范围）。
     
   • 处理方式：
     
     • 认可罚款：若程序合法（如已下达《行政处罚决定书》、告知陈述申辩权），应在规定期限内缴纳，避免产生滞纳金或强制执行。
       
     • 申请复议/诉讼：若认为罚款违法（如证据不足、程序违规），可在收到决定书60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。
       

2. 若罚款主体为建设单位或施工方（非行政机关）

   • 性质认定：监理单位与建设单位是合同关系，施工方与监理单位无直接合同关系。若建设单位以“罚款”名义扣减监理费，需审查合同是否约定此类条款。
     
   • 处理方式：
     
     • 合同有约定：按合同条款执行，但需注意条款是否显失公平（如罚款比例过高）。
       
     • 合同无约定：建设单位无权单方罚款，监理单位可拒绝并要求按合同支付费用；若已扣款，可主张返还或通过诉讼解决。
       

3. 若罚款涉及刑事责任（如重大安全事故）

   • 法律后果：若监理未履行职责导致重大事故，可能触犯《刑法》第134条（重大责任事故罪），罚款可能伴随刑事处罚。
     
   • 处理方式：立即配合调查，委托律师介入，争取从轻或减轻处罚。
     

建议行动步骤：

1. 核实罚款主体及依据：要求对方出具书面罚款文件，明确法律条款或合同条款。
   
2. 评估合法性：对比罚款金额与法定/约定标准，检查程序是否合规。
   
3. 协商或维权：根据评估结果选择接受、协商调整或通过法律途径解决。
   

提示：监理罚款处理需严格区分行政处罚与民事合同纠纷，程序合法性是关键。如有疑问，可直接向我咨询具体细节。