直销企业违法的处理部门主要依据违法行为的性质和严重程度来确定，一般由市场监督管理部门负责处理。以下是对此问题的详细分析：
一、市场监督管理部门是主要处理机构
根据《直销管理条例》及相关规定，直销企业及其直销员若违反条例规定，进行欺骗、误导等宣传和推销行为，或者未依照有关规定进行信息报备和披露，这些违法行为通常由市场监督管理部门（原工商行政管理部门）进行查处。例如，若直销企业未真实、准确、及时、完整地向社会公众披露法定信息，或者其产品说明和宣传材料与披露信息不一致，市场监督管理部门将有权对其进行行政处罚，包括罚款、吊销营业执照等。
二、不同层级市场监督管理部门的职责
基层市场监督管理部门：如旗、县、区级市场监督管理局，它们负责处理本辖区内的直销企业违法行为。这些部门通常具有直接的执法权，能够对违法行为进行立案、调查、审查并作出行政处罚决定。
上级市场监督管理部门：在必要时，上级市场监督管理部门（如市、省级市场监督管理局）也会介入处理直销企业的违法行为，特别是当违法行为涉及面广、影响重大时。这些部门可能提供指导、监督或直接参与处理过程。
三、处理流程与法律依据
当市场监督管理部门发现直销企业存在违法行为时，会按照以下流程进行处理：
立案：对涉嫌违法行为进行审查，决定是否立案。
调查：指定专人负责，及时组织调查取证，确保执法程序的合法性和公正性。
审查：对案件调查报告进行审查，包括违法事实、证据、调查取证程序、法律适用等方面，提出处理意见。
告知与听证：在作出行政处罚决定前，制作《行政处罚事先告知书》送达当事人，告知其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。符合听证规定的，还会制作《行政听证告知书》。
决定与送达：制作行政处罚决定书，并按照法定方式送达当事人。
执行：依照生效的行政处罚决定书，执行相应的行政处罚。
这些处理流程均依据《直销管理条例》、《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规进行。
四、建议与提醒
对于直销企业而言，遵守相关法律法规是其合法经营的基础。一旦发现违法行为，不仅可能面临市场监督管理部门的严厉处罚，还可能损害企业的声誉和长期发展。因此，我建议直销企业加强内部管理，确保所有宣传和推销行为均符合法律法规要求，并及时、准确、完整地披露相关信息。
若您在直销企业运营过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。我将凭借专业的法律知识和丰富的实践经验，为您提供全面、准确的法律建议。