企业土地转让协议书的法律效力主要取决于多个关键因素，这些因素共同构成了协议有效性的基础。以下是对此问题的详细分析：
一、协议内容的合法性
符合法律法规：土地转让协议书的内容必须严格遵守国家相关法律法规的规定。例如，《中华人民共和国土地管理法》以及《农村土地承包法》（若涉及农村土地）等，对土地使用权的出让和转让都有明确的规定。协议内容若违反这些法律法规，将被视为无效。
不损害公共利益：协议内容不得损害国家、集体或第三人的利益。如果协议涉及非法转让、侵占国有土地或集体土地，或者以其他方式损害公共利益，那么这样的协议将不受法律保护。
二、签订主体的资格
具备民事行为能力：土地转让协议的签订主体可以是自然人或法人，但必须具备相应的民事行为能力。无民事行为能力人或限制民事行为能力人签订的协议，可能因主体不适格而被视为无效。
权属清晰：转让方必须是土地的合法所有者或使用权人，且土地权属无争议。如果转让方无权处分土地，或者土地权属存在争议，那么协议将因权属不清而无效。
三、法定审批程序
依法登记：根据相关法律法规，土地使用权的转让通常需要经过相关部门的批准和登记。未经登记的转让行为，可能不具有法律效力。这是因为登记是确认土地使用权转移的重要法律程序。
特定类型土地的转让限制：对于某些特殊类型的土地，如农村宅基地、耕地等，其转让可能受到法律的严格限制或禁止。例如，农村宅基地一般只能在本集体经济组织内部成员之间转让，且需要经过发包方的同意。若违反这些限制，协议可能无效。
四、其他影响法律效力的因素
意思表示真实：协议双方的意思表示必须真实、自愿，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的协议，受损害方有权请求撤销协议。
形式要件：虽然土地转让协议通常不要求特定的形式（如必须采用书面形式），但为了避免纠纷和便于证明，建议双方签订书面协议，并明确约定各项条款，包括转让价格、期限、违约责任等。
五、实践建议
咨询专业律师：在签订土地转让协议前，建议咨询专业律师，确保协议内容的合法性和有效性，避免潜在的法律风险。
办理变更登记：转让完成后，应及时到相关部门办理土地变更登记手续，确保转让的合法性，保护双方的合法权益。
综上所述，企业土地转让协议书的法律效力取决于协议内容的合法性、签订主体的资格、法定审批程序以及其他影响法律效力的因素。在实际操作中，双方应严格遵守相关法律法规，确保协议的合法性和有效性，以维护自身的合法权益。