民事诉讼中，行政职能部门越权作出的行政行为，一般不能成为有效证据。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、越权行政行为的法律效力
越权无效原则：
- 根据行政法的基本原则，行政机关必须在法定权限范围内行使职权。越权作出的行政行为，因其违反了法定权限，通常被视为无效行为。这种无效性不仅体现在行政行为的实体内容上，也影响其作为证据的效力。
证据的合法性要求：
- 在民事诉讼中，证据必须具备合法性、真实性和关联性。越权作出的行政行为，由于其本身违法，无法满足证据合法性的要求，因此不能作为有效证据使用。
二、越权行政行为作为证据的具体分析
直接证据无效：
- 如果行政职能部门越权作出的行政行为直接作为民事诉讼中的证据，例如作为证明某事实存在的依据，那么由于该行政行为本身无效，其证明力也将被否定。法院在审查证据时，会排除这种非法证据。
间接影响证据效力：
- 即使越权行政行为不直接作为证据使用，但其内容可能间接影响其他证据的效力。例如，如果越权行政行为中包含了某些事实认定，而这些事实认定又被其他证据所引用或依赖，那么这些事实认定的合法性也将受到质疑，进而影响整个证据链的效力。
三、特殊情况下的考量
行政行为被追认或转化：
- 在极少数情况下，如果越权行政行为事后被有权机关追认或转化为合法行政行为，那么其效力可能得到恢复。但这种情况非常罕见，且需要严格的法律程序和条件。
民事诉讼中的自认规则：
- 如果在民事诉讼中，一方当事人自认了越权行政行为中的某些事实，那么根据自认规则，这些事实可能被视为真实。但这种情况并不改变越权行政行为本身的无效性，只是影响了特定事实的认定。
四、法律建议
对行政相对人的建议：
- 如果您是行政相对人，面对行政职能部门越权作出的行政行为，应当及时提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
对民事诉讼当事人的建议：
- 如果您是民事诉讼的当事人，发现对方提交了越权行政行为作为证据，应当及时向法院提出异议，要求排除该非法证据。同时，您也可以积极收集其他合法证据来支持自己的主张。
总结来说，民事诉讼中行政职能部门越权作出的行政行为一般不能成为有效证据。如果您在民事诉讼中遇到了此类问题，或者对行政行为的合法性有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。