特殊行业分公司不能以总公司的资质投标。下面我将从法律角度详细解释这一结论：

1. 资质独立性：

   • 资质是一种行政许可，它代表了特定组织或个人在某一领域内的专业能力和资格。这种许可通常是针对具体的法人实体颁发的，不可私相授受。
   • 分公司作为总公司的组成部分，虽然在一定程度上可以代表总公司进行业务活动，但在法律上，分公司并不具备独立的法人资格，因此不能独立拥有或使用资质。

2. 投标法律规定：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》的规定，投标人是响应招标、参加投标竞争的法人或者其他组织。这里明确指出了投标人必须是法人或其他组织，且应具备承担招标项目的能力。
   • 分公司作为非独立法人，不能以自己的名义独立参与投标，除非得到总公司的明确授权，并以总公司的名义进行投标。在这种情况下，分公司实际上扮演的是总公司授权代表的角色，而非独立的投标人。

3. 实际案例分析：

   • 在实际案例中，如果分公司未经总公司授权而擅自使用总公司的资质进行投标，这样的投标通常会被视为无效。因为这不仅违反了资质管理的相关规定，也违背了招标投标法的精神。

综上所述，特殊行业分公司不能以总公司的资质进行投标。如果分公司需要参与投标活动，应该通过合法途径获得相应的资质，或者得到总公司的明确授权并以总公司的名义进行投标。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。