针对您提出的问题，当交通事故对方全责，但对方车辆只有交强险，赔付的两千元不够修车费用，且已经起诉对方的情况，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确交强险的赔偿限额。交强险中，对于财产损失（如车辆维修费用）的赔偿限额是2000元。当事故损失超过这个限额时，超出部分需要由责任方（即对方）自行承担。由于对方没有购买商业险，这部分超出费用无法由保险公司赔付。

接下来，针对您已经起诉对方的情况，以下是一些建议：

1. 准备充分证据：

   • 确保您拥有完整的事故责任认定书，这是证明对方全责的关键证据。
   • 保留所有与车辆维修相关的发票、定损单等，以证明您的实际损失。
   • 如果有现场照片、目击者证言等，也一并收集，以增强证据的说服力。

2. 通过法律途径追讨赔偿：

   • 既然已经起诉，接下来需要按照法院的诉讼流程进行。
   • 在庭审中，向法官清晰陈述事故经过、损失情况以及对方拒不赔偿的情况。
   • 提交所有准备好的证据，支持您的诉讼请求。

3. 考虑执行问题：

   • 如果法院判决对方赔偿，但对方拒不履行，您可以向法院申请强制执行。
   • 强制执行可能涉及查封、冻结对方财产等措施，以确保您的赔偿能够得到落实。

4. 寻求专业法律帮助：

   • 如果您不熟悉法律程序或感到困惑，可以考虑聘请律师代理您的案件。
   • 律师能够为您提供专业的法律建议，帮助您更好地维护自己的权益。

最后，需要提醒的是，整个诉讼过程可能需要一定的时间和精力。请保持耐心，并积极配合法院的工作。同时，也要注意保护自己的合法权益，不要轻易放弃追讨赔偿的权利。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。