针对您提出的“纸质合同盖电子章有效吗”这一问题，我们可以从法律角度和实际操作层面进行详细分析。

首先，从法律层面来看，盖章的电子合同（包括在纸质合同上以电子形式体现的盖章）在符合相关法律法规规定的前提下，是具有法律效力的。这主要基于以下几点：

1. 电子签名的法律效力： 根据《中华人民共和国电子签名法》，可靠的电子签名与手写签名或盖章具有同等的法律效力。这意味着，只要电子签名满足法律规定的条件，如电子签名制作数据专属于电子签名人、签署时该数据仅由电子签名人控制等，那么电子签名在法律上就与手写签名或盖章具有相同的效力。

2. 合同形式的多样性： 《中华人民共和国民法典》规定，当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或其他形式。其中，书面形式不仅限于传统的纸质合同，还包括以电子数据交换、电子邮件等方式有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文。因此，电子合同作为数据电文的一种，是书面合同的一种法定形式。

3. 合同内容的合法性： 无论合同是纸质形式还是电子形式，其内容都必须合法合规，不得违反法律法规的强制性规定，也不得损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益。这是合同有效性的基本前提。

接下来，从实际操作层面来看，纸质合同上盖电子章的有效性还取决于具体的使用场景和签署方式：

• 如果电子章是通过可靠的电子签名技术生成的，并且该技术能够确保签名的真实性和完整性（如防止篡改、伪造等），那么这种电子章在纸质合同上的使用就是有效的。
• 然而，在实际操作中，一些传统的纸质合同签署场景可能并不直接支持电子章的使用。这时，可能需要通过打印出电子合同并加盖传统印章，或者通过其他方式（如双方确认的电子邮件、短信等）来证明合同的真实性和有效性。

综合建议：

• 在使用电子章签署纸质合同时，建议确保电子章是通过可靠的电子签名技术生成的，并且该技术符合相关法律法规的规定。
• 如果可能的话，可以考虑使用第三方电子合同服务提供商的服务，这些服务提供商通常能够提供更安全、更可靠的电子签名和合同签署解决方案。
• 在遇到具体问题时，建议咨询专业的法律顾问以确保合同的合法性和有效性。

总之，纸质合同上盖电子章的有效性取决于多个因素，包括电子签名的可靠性、合同内容的合法性以及具体的使用场景和签署方式。在符合相关法律法规规定的前提下，盖章的电子合同是具有法律效力的。