当您的摩托车因交通违法行为被扣3分时，您需按照以下步骤进行处理，以确保合规并避免后续不必要的麻烦：

一、确认违章信息

首先，您需要通过可靠途径查询摩托车的具体违章行为和扣分情况。推荐的方式有：

• 线上查询：登录交通管理部门官方网站（例如“交管12123”）或使用手机APP，绑定摩托车车辆信息后，即可查询到详细的违章记录，包括违章时间、地点、原因及扣分和罚款金额。
• 线下查询：携带本人身份证和摩托车行驶证，前往当地车管所的违章处理窗口，由工作人员帮您查询违章信息。

二、准备相关材料

为了顺利处理违章，您需要准备以下材料：

• 驾驶证：请确保驾驶证处于正常状态，没有被吊销或暂扣。
• 行驶证：用于证明摩托车的合法身份。
• 身份证：用于确认处理违章人员的身份。

三、缴纳罚款

根据查询到的违章情况，您需要及时缴纳罚款。缴纳方式包括：

• 线上支付：通过“交管12123”APP、微信、支付宝等第三方支付平台，输入处罚决定书编号等相关信息进行缴纳。
• 线下缴纳：前往指定的银行网点，将罚款交给银行工作人员，或根据处罚决定书上的提示，通过其他指定方式进行缴纳。

在缴纳罚款时，请务必核对罚款金额和缴纳账户，确保资金安全，并注意缴纳罚款的时间限制，避免产生滞纳金。

四、处理扣分

缴纳罚款后，您需要携带相关材料到当地交警大队或车管所的违章处理窗口处理扣分事宜。工作人员会核对您的违法信息，并在您的驾驶证上扣除相应的分数。

五、重要提醒与注意事项

• 记分周期：请了解您的驾驶证记分周期（通常为12个月，从初次领证日期开始计算）。在一个记分周期内，如果记分未达到12分，并且您已经缴清了所有罚款，那么记分会在记分周期结束时自动清除。
• 避免再次扣分：为了您的驾驶安全，请严格遵守交通规则，避免再次被扣分。
• 及时处理：如果您收到了现场开具的罚单，一般需要在规定时间内（如15天内）处理并缴纳罚款，否则可能会产生滞纳金。
• 咨询专业意见：如果您对处理流程有任何疑问或对处罚有异议，建议及时咨询专业的法律人士或直接联系交警部门获取准确的指导。

综上所述，摩托车被扣3分后，您应按照规定流程确认违章信息、准备相关材料、缴纳罚款并处理扣分事宜。同时，加强交通安全意识，遵守交通规则，确保您的驾驶安全。