校车超载50%以上是一个严重的交通违法行为，它严重威胁到学生的生命安全。根据现行有效的法律法规，对于校车超载50%以上的处罚措施是非常严厉的，具体包括以下几个方面：

1. 罚款：校车超载50%以上，将处以五百元以上二千元以下的罚款。这是对违法行为直接的经济处罚，旨在通过经济手段来遏制超载行为。

2. 扣分：根据相关规定，校车超载50%以上，驾驶员的一次性扣分将达到12分。这意味着驾驶员的驾驶证将被暂扣，并需要重新参加交通安全法律法规的学习和考试，合格后才能重新获得驾驶资格。

3. 吊销从业资格证：对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，还将处以二千元以上五千元以下的罚款，并且由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。这是对校车运营单位和责任人员的严厉处罚，旨在强化其安全管理责任。

4. 刑事责任：如果校车超载行为严重到构成犯罪，如从事校车业务或者旅客运输，严重超过额定乘员载客，那么将依法追究刑事责任。这意味着相关责任人员可能面临牢狱之灾。

5. 吊销驾驶证及禁驾：公安机关交通管理部门还将吊销校车驾驶员的机动车驾驶证，并且十年内不得重新取得机动车驾驶证。即使十年后重新取得驾驶证，也不得再从事校车业务或者旅客运输。这是对校车驾驶员的极端处罚，旨在彻底剥夺其从事校车驾驶的资格。

综上所述，校车超载50%以上的处罚措施非常严厉，包括罚款、扣分、吊销从业资格证、刑事责任以及吊销驾驶证并禁驾等。这些措施旨在通过法律手段来保障学生的出行安全，遏制校车超载等严重违法行为的发生。因此，校车运营单位和驾驶员必须严格遵守交通安全法律法规，确保校车的安全运营。