股份有限公司破产时，员工的赔偿主要依据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定进行处理。

一. 破产清偿顺序

1. 破产费用和共益债务优先清偿：根据《企业破产法》第四十三条，破产费用和共益债务由债务人财产随时清偿。这是破产清偿中的第一顺序。
2. 劳动债权优先于普通债权：根据《企业破产法》第一百一十三条，破产财产在清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：首先是破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金（即劳动债权）；其次是破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；最后是普通破产债权。

二. 员工赔偿的具体处理

1. 工资、医疗等费用的支付：在股份有限公司破产时，员工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用等，均属于优先清偿的范畴。
2. 补偿金的支付：除上述费用外，公司破产时还应支付员工法律、行政法规规定的补偿金，这也属于劳动债权的一部分，同样优先于普通债权清偿。

三. 实际操作建议

1. 及时申报债权：员工在得知公司破产的消息后，应及时向破产管理人申报自己的债权，包括工资、医疗、补偿金等。
2. 关注破产进程：员工应密切关注公司的破产进程，以便及时了解自己的债权何时能够得到清偿。

我建议，作为员工，在面临公司破产时，应保持冷静，了解自己的权益和清偿顺序，及时申报债权，并关注破产进程。如有进一步需要，您可以继续咨询我。