在双方各50%责任的交通事故中，修车费用应先由双方交强险在财产损失赔偿限额内互赔，超出部分由双方按照50%的比例分担。具体处理方式如下：

一. 交强险赔偿

• 双方交强险在财产损失赔偿限额内（一般为2000元）互赔。例如，一方修车费5000元，另一方修车费3000元，先由双方交强险分别向对方赔偿2000元。

二. 超出交强险部分的分担

• 超出交强险赔偿限额的部分，由于双方责任各半，由双方按照50%的比例分担。继续上述例子，一方超出交强险的修车费为3000元（5000-2000），另一方超出交强险的修车费为1000元（3000-2000），则双方各自承担超出部分的一半，即一方需再承担对方超出部分的500元（1000×50%），另一方需承担对方超出部分的1500元（3000×50%）。

三. 实际操作中的注意事项

• 在实际操作中，可能是由一方先垫付全部的修车费用，然后再根据责任比例进行分摊。
• 双方需要提供相关的修车发票、事故证明等材料，以便保险公司进行审核和赔付。
• 如果双方在修车费用或赔偿方式上存在争议，可以通过协商、调解或诉讼等方式来解决。

我建议，在处理此类事故时，双方应保留好所有相关证据，如事故现场照片、事故认定书等，以便在后续协商或诉讼中使用。同时，应积极配合保险公司的定损和理赔流程，以确保双方权益得到保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。