客车运输香烟的合法数量是每人每次最多携带1万支（50条）。具体分析如下：

一. 香烟运输的合法数量

• 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及相关规定，个人乘坐车、船、飞机等交通工具，跨地（市）携带卷烟的最高限量为每人次1万支（50条）。在此限量以内携带卷烟，不需办理携带证明。
• 若超过这一限量，则必须持有烟草专卖行政主管部门或者烟草专卖行政主管部门授权的机构签发的准运证，否则视为非法运输。

二. 非法运输的后果

• 无烟草专卖批发企业许可证的单位或者个人，一次销售卷烟、雪茄烟50条以上的，或者超过规定限量携带卷烟的，将视为无烟草专卖批发企业许可证从事烟草制品批发业务，由烟草专卖行政主管部门责令关闭或者停止经营烟草制品批发业务，没收违法所得，并处罚款。
• 承运人明知是烟草专卖品而为无准运证的单位、个人运输的，也将受到相应的处罚，包括没收违法所得，并可以并处违法运输的烟草专卖品价值10%以上20%以下的罚款。

综上所述，在客车上运输香烟时，每人每次最多可携带50条香烟，超过此数量则必须持有准运证，否则将构成非法运输。如有进一步需要，您可以继续咨询我。