药品运输记录未做或不全，由药品监督管理部门责令限期改正，给予警告；逾期不改正的，将处以五千元以上二万元以下的罚款。具体分析如下：

一. 法律依据明确

• 根据《药品流通监督管理办法》第三十条，对于药品生产、经营企业的相关违规行为，包括未按照规定留存有关资料、销售凭证等，药品监督管理部门将责令限期改正，并给予警告；若逾期不改正，将处以五千元以上二万元以下的罚款。虽然该条款未直接提及“药品运输记录”，但“未按照规定留存有关资料”可以涵盖运输记录不全或未做的情况，因为运输记录是药品流通环节中的重要资料。

二. 处理流程清晰

1. 责令改正与警告：药品监督管理部门在发现药品运输记录未做或不全时，会首先责令企业限期改正，并给予警告。
2. 罚款处罚：若企业在规定期限内未进行整改或整改不到位，药品监督管理部门将依据法规处以五千元以上二万元以下的罚款。

三. 实际案例警示

• 例如，某药品经营企业因未建立完善的药品运输记录，被药品监督管理部门查处。在接到责令改正通知后，该企业未及时整改，最终被处以一万元的罚款。这一案例警示我们，药品运输记录的完整性和规范性对于药品流通企业至关重要。

我建议，药品生产、经营企业应高度重视药品运输记录的建立和完善，确保记录的真实、完整和可追溯性，以避免可能的法律风险和经济损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。