因超速被扣12分，不会留下案底。详细分析如下：

一. 案底的含义及与扣分的关系

1. 案底定义：在法律上，“案底”通常指的是一个人因犯罪被判刑后，在个人档案中留下的犯罪记录。
2. 扣分性质：驾驶证因超速被扣12分，是交通管理部门对驾驶人违反交通规则（即超速）的一种行政处罚，它并不等同于刑事犯罪记录。

• 例如，你因超速行驶被交警查处，并因此被扣了12分，这只是一种行政处罚，与犯罪记录无关。

二. 超速扣分的法律后果

1. 暂扣驾驶证：当驾驶证因超速等交通违法行为被扣满12分时，驾驶证将被交通管理部门暂扣。
2. 学习考试：驾驶人需按规定参加交通安全法律、法规的学习并接受考试。考试合格后，记分予以清除，并发还驾驶证；若考试不合格，则需继续参加学习和考试。
3. 停止使用：拒不参加学习或不接受考试的，公安机关交通管理部门将公告其机动车驾驶证停止使用。

• 例如，你被扣12分后，需要按照交通管理部门的要求去参加学习和考试，只有通过考试，你的记分才会被清除，并能重新获得驾驶证。

三. 案底与犯罪行为的关联

1. 区分界限：超速等交通违法行为与犯罪行为有明确的界限。只有当交通违法行为严重到构成犯罪（如交通肇事逃逸、醉酒驾驶等）时，才会在个人犯罪记录中留下案底。
2. 超速不构成犯罪：单纯的超速行驶，即使被扣12分，也不属于犯罪行为，因此不会留下案底。

综上所述，因超速被扣12分，只是交通管理部门对驾驶人的一种行政处罚，并不会在个人犯罪记录中留下案底。但驾驶人也应严格遵守交通规则，确保行车安全，避免触犯法律底线。如有进一步需要，您可以继续咨询我。