金融企业改制未按批准事项办理变更登记，且擅自新设立分支机构的，将面临行政处罚、民事责任以及可能的刑事责任等法律后果。以下是对此问题的详细分析：
一、行政处罚
未办理变更登记的处罚：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，公司变更登记事项，未按照规定办理有关变更登记的，由公司登记机关责令限期登记；逾期不登记的，处以一万元以上十万元以下的罚款。对于金融企业而言，若其改制后未按批准事项办理变更登记，同样可能面临此类处罚。
擅自设立分支机构的处罚：
- 金融企业擅自设立分支机构，可能违反了金融监管机构的相关规定。根据《中华人民共和国商业银行法》或其他相关金融法规，未经批准擅自设立分支机构的，金融监管机构有权责令改正，并可能处以罚款。罚款的数额可能根据违规情节的严重程度而定，从几万元到几百万元不等。
二、民事责任
对债权人的责任：
- 金融企业改制后未按批准事项办理变更登记，且擅自设立分支机构，可能导致其资产和负债情况不清晰，进而影响债权人的权益。若因此给债权人造成损失，金融企业可能需要承担相应的民事赔偿责任。
对股东的责任：
- 股东作为公司的投资者，有权了解公司的真实情况和财务状况。若金融企业改制后未按批准事项办理变更登记，且擅自设立分支机构，导致股东权益受损，股东可能要求金融企业承担民事责任，包括赔偿损失等。
三、刑事责任（在极端情况下）
- 虽然一般情况下，金融企业改制未按批准事项办理变更登记且擅自设立分支机构的行为不直接构成犯罪，但在某些极端情况下，如该行为涉及欺诈、非法集资等严重违法犯罪活动时，相关责任人员可能面临刑事责任的追究。
四、其他后果
声誉损失：
- 金融企业作为经营货币和信用的特殊行业，其声誉至关重要。改制后未按批准事项办理变更登记且擅自设立分支机构的行为，可能损害金融企业的声誉，进而影响其业务发展和客户信任。
监管限制：
- 金融监管机构可能对违规的金融企业采取限制措施，如限制其业务范围、暂停其新业务开展等，以督促其整改并规范经营。
建议与措施：
- 立即整改：金融企业应尽快按照批准事项办理变更登记，并撤销擅自设立的分支机构或补办相关手续。
- 加强内部管理：建立健全内部管理制度，确保公司变更登记事项及时、准确办理，避免类似违规行为再次发生。
- 积极与监管机构沟通：主动向金融监管机构报告情况，接受监管指导，争取从轻或免除处罚。
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